带有 HDFS 的 Sparkr Read/Write

Sparkr Read/Write with HDFS

我正在尝试弄清楚如何在 SparkR 中读取和写入任意文件 to/from HDFS。

设置为:

args <- commandArgs(trailingOnly = T)
MASTER <- args[1]
SPARK_HOME <- args[2]
INPATH <- 'hdfs/path/to/read/or/load/from'
OUTPATH <- 'hdfs/path/to/write/save/to'

Sys.setenv(SPARK_HOME = SPARK_HOME) 
.libPaths(c(file.path(Sys.getenv('SPARK_HOME'), 'R', 'lib'), .libPaths())
library(SparkR)

sparkR.session(master = MASTER)

# How to load RData?
load(paste(INPATH, rObjects.RData, sep = '')

# How to read data?
dat <- read.csv(paste(INPATH, datafile.csv, sep = '')

# Perform operations.....

# How to write?
write.csv(dat, paste(OUTPATH, outdata.csv, sep = '')

我知道这些过程可以通过 shell 脚本或 R 中的类似系统调用来完成,例如:

system('hadoop fs -copyToLocal ...')

但是,我有意避免使用这些解决方案。

Spark 2.0.1 版

R v. 3.3.2

编辑: 下面的评论指出这可能是重复的——这个问题更具体地涉及阅读 csvs(我的问题的一部分),但仍然不清楚如何更普遍地加载 .RData 或 read/write 文件。

要在 SparkR 中读取和写入数据帧,请使用这些

sdf <- read.df(csvPath, "csv", header = "true", inferSchema = "true", na.strings = "NA")
write.df(people, path = "people. csv", source = "csv", mode = "overwrite")

要使用 rdd,请使用这些

rdd <- SparkR:::textFile(sc = sc,path = "path",minPartitions = 4)
SparkR:::saveAsTextFile(X,"path")

Databricks 有一个很好的包,可以在 SparkR 中处理 csv 文件,link