使用带有 typedef 的 Rcpp 的编译错误

Question

我正在使用 RcppEigen 为我的 R 包编写一些 C++ 组件，但在此上下文中使用 typedef 时遇到问题。以下代码无法编译：

// [[Rcpp::depends(RcppEigen)]]
#include <RcppEigen.h>

using namespace Rcpp;

typedef Eigen::ArrayXd MapAr1;

// [[Rcpp::export]]
MapAr1 myFun(const MapAr1& x){

  MapAr1 y = x;
  y[0] = 0;

  return y;

}

这里是错误：

==> Rcpp::compileAttributes()

* Updated src/RcppExports.cpp
* Updated R/RcppExports.R

==> devtools::document(roclets=c('rd', 'collate', 'namespace'))

Updating my_package documentation
Loading my_package
Re-compiling my_package
'/usr/lib64/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore  \
  --quiet CMD INSTALL '/my_path/my_package'  \
  --library='/tmp/RtmpgPjAdf/devtools_install_125071da0b53' --no-R --no-data  \
  --no-help --no-demo --no-inst --no-docs --no-exec --no-multiarch  \
  --no-test-load 

* installing *source* package ‘my_package’ ...
g++ -m64 -I/usr/include/R -DNDEBUG  -I/usr/local/include -I"/my_path/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/Rcpp/include" -I" /my_path/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/RcppEigen/include"   -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches   -m64 -mtune=generic  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
** libs
RcppExports.cpp:10:1: error: ‘MapAr1’ does not name a type
 MapAr1 myFun(const MapAr1& x);
 ^
RcppExports.cpp: In function ‘SEXPREC* my_package_myFun(SEXP)’:
RcppExports.cpp:15:42: error: ISO C++ forbids declaration of ‘type name’ with no type [-fpermissive]
     Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
                                          ^
RcppExports.cpp:15:50: error: template argument 1 is invalid
     Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
                                                  ^
RcppExports.cpp:15:58: error: expected initializer before ‘x’
     Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
                                                          ^
RcppExports.cpp:16:40: error: ‘x’ was not declared in this scope
     rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(myFun(x));
                                        ^
RcppExports.cpp:16:41: error: ‘myFun’ was not declared in this scope
     rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(myFun(x));
                                         ^
make: *** [RcppExports.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘my_package’
* removing ‘/tmp/RtmpgPjAdf/devtools_install_125071da0b53/my_package’
Error: Command failed (1)
Execution halted

Exited with status 1.

相同的代码在包外编译。所以我猜有些东西没有正确复制到 RcppExports 文件中。我在尝试使用 RcppEigen 命名空间时也注意到类似的问题：using namespace RcppEigen; is not copied.

知道如何在不手动修改 RcppExports 的情况下解决这个问题吗？谢谢！

Answer 1

你坚持 typedef 让你的生活变得太复杂了。一旦你将它包含在文件中， 和你的函数签名，它就成为界面的一部分，因此也需要在你的 RcppExports.cpp 中。所以你需要提供它 'one level higher'.

但是有一个规定：调用文件 pkgname_types.h 它将被包含。我创建了一个简单的包 eigentest 并在 src/ 目录中添加了一个文件 eigentest_types.h：

#include <RcppEigen.h>

typedef Eigen::ArrayXd MapAr1;

然后使用

将其添加到您的代码片段中

#include "eigentest_types.h"

而不是 typedef。

这就是您所需要的——只需将 eigentest 替换为您的包名称即可。

使用带有 typedef 的 Rcpp 的编译错误

Compilation error using Rcpp with typedef

c++

r

rcpp

eigen

r-package