在 matplotlib 中绘制与散点颜色匹配的误差线

Question

我见过很多与这个问题相同的问题，但在准确回答我的问题或我可以应用它们之前，它们似乎总是有一点分歧。

我希望以与散点图点相同的配色方案绘制误差线。如果我的值绘制在 x 和 y 轴上，并且我希望它们随另一个 Z 值以对数方式改变颜色，目前我有：

c = np.abs(zVals)
cmhot = plt.get_cmap("plasma")

sc.set_clim(vmin=min(zVals), vmax=max(zVals))

sc = plt.scatter(xVals, yVals, c=c, norm=mplc.LogNorm(), 
s=50, cmap=cmhot, edgecolors='none')

###This section all works fine, it is when I introduce the error bars I struggle

norm = mplc.LogNorm(vmin=min(zVals), vmax=max(zVals)

plt.errorbar(xVals, yVals, yerr = [negyVals,posyVals], c=cmhot(norm(zVals)))
plt.colorbar(sc)


plt.ylim([-10,110])
plt.xlim([1,100])

plt.xscale('log')


plt.show()

这会导致以下形式的错误：

ValueError: to_rgba: Invalid rgba arg ... length of rgba sequence should be either 3 or 4

我对一般的颜色情况很困惑，所以目前任何帮助都将不胜感激。干杯。

Answer 1

我认为这在 matplotlib 中很难做到。我发现的唯一方法是使用 for 循环，并单独绘制每个点。

例如

plt.figure()

#data
x=np.linspace(-10, 10, 100)
y=np.cos(x)
y_error=0.2+0.5*np.random.randn(len(x))
z=np.linspace(0, 10, 100)

cm=plt.get_cmap('plasma')
plt.scatter(x, y, c=z_values, cmap=cm, zorder=10)


for i, (xval, yval, y_error_val, zval) in enumerate(zip(x, y, y_error, z)):

    #Get the colour from the colourmap
    colour=cm(1.0*zval/np.max(z))
    #(could also just do colour=cm(1.0*i/len(x)) here)
    #(Or Norm(zval) in your case)

    plt.errorbar(xval, yval, yerr=y_error_val, linestyle='', c=colour)

plt.show()

这给出 this plot

显然，对于大量的点，这不是很有效！

在 matplotlib 中绘制与散点颜色匹配的误差线

Plotting error bars in matplotlib that match scatter colours

python

plot

scatter

colors

errorbar