vegan 包中 capscale 函数的替代示例
Alternative example for capscale function in vegan package
我一直在学习 PRIMER 中的多元分析，但现在想使用 vegan 包转换为 R。我想在 vegan 中使用 capscale() 函数，但我不确定我的数据应该如何预先格式化。
在小插图 http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan/html/capscale.html 的示例中，dataframes（varespec 和 varechem）都只有数值，但我有一个 dataframe 依赖（数字）值，以及另一个独立（因子）值。所以我要的是一个我可以效仿的替代示例。我在网上找不到任何东西。
iris 数据集应该提供足够的玩具数据。谢谢
您使用的小插图来源严重过时：我必须将其从 Web 上删除。 ?capscale 的帮助页面应该在您当前的 vegan 安装中包含更多最新文档。对于具有因子的独立数据，您应该能够使用任何其他约束排序帮助（?rda）的模型，它告诉您使用 formula 接口您可以在独立数据中具有因子 - 并且formula 接口是 capscale.
中唯一允许的接口
您应该在 vegan 中从 capscale 切换到 dbrda：capscale 将来可能会被弃用。
我一直在学习 PRIMER 中的多元分析，但现在想使用 vegan 包转换为 R。我想在 vegan 中使用 capscale() 函数，但我不确定我的数据应该如何预先格式化。
在小插图 http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan/html/capscale.html 的示例中，dataframes（varespec 和 varechem）都只有数值，但我有一个 dataframe 依赖（数字）值，以及另一个独立（因子）值。所以我要的是一个我可以效仿的替代示例。我在网上找不到任何东西。
iris 数据集应该提供足够的玩具数据。谢谢
您使用的小插图来源严重过时：我必须将其从 Web 上删除。 ?capscale 的帮助页面应该在您当前的 vegan 安装中包含更多最新文档。对于具有因子的独立数据，您应该能够使用任何其他约束排序帮助（?rda）的模型，它告诉您使用 formula 接口您可以在独立数据中具有因子 - 并且formula 接口是 capscale.
您应该在 vegan 中从 capscale 切换到 dbrda：capscale 将来可能会被弃用。