Python os.walk: 添加文件夹名称输出

Python os.walk: add folder names to output

我有以下脚本,效果很好,但现在我想将文件夹的名称添加到输出文件中。该脚本与 os.walk 一起进入当前工作文件夹的子目录,我想将子目录文件夹名称添加到输出中。最好,我只想将文件夹名称(而不是整个路径)添加到输出文件的第一行。谁能帮我修改脚本? 提前致谢!

import os
import csv
from itertools import chain
from collections import defaultdict


def get_file_values(find_files, output_name):
    for root, dirs, files in os.walk(os.getcwd()):
        if all(x in files for x in find_files):
            outputs = []
            for f in find_files:
                d = {}
                with open(os.path.join(root, f), 'r') as f1:
                    for line in f1:
                        ta = line.split()
                        d[ta[1]] = int(ta[0])
                outputs.append(d)

            d3 = defaultdict(list)
            for k, v in chain(*(d.items() for d in outputs)):
                d3[k].append(v)

            with open(os.path.join(root, output_name), 'w+') as fnew:
                writer = csv.writer(fnew)
                for k, v in d3.items():
                    writer.writerow([k] + v)

get_file_values(['genes.gff.genespercontig.csv', 'hmmer.analyze.txt.results.txt'], 'output_contigsvsgenes.csv')

您可以使用 os.listdir(path) 获取所有子目录和文件名。

参见:https://docs.python.org/2/library/os.html

例如,

os.listdir('.')表示当前目录,os.listdir('../')表示上一级目录。

os.path.relpath('.','..') 给出当前目录的文件夹名称。