将值重新分配给 ffdf [R] 中的列

Question

我在更大的数据集中执行以下操作时遇到问题。我想知道是否有使用 ff 或 ffdf 的内置方法。

示例：使用 substr 修改 ffdf 对象中的字符列并将其重新分配为不同的列：

require(ffbase)
> iris
    Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width    Species
1            5.1         3.5          1.4         0.2     setosa
2            4.9         3.0          1.4         0.2     setosa
3            4.7         3.2          1.3         0.2     setosa
4            4.6         3.1          1.5         0.2     setosa

#Convert to ff object
A <- as.ffdf(iris)

我可以访问 "Species" 列

A$species
> A$Species
ff (open) integer length=150 (150) levels: setosa versicolor virginica
      [1]       [2]       [3]       [4]       [5]       [6]       [7]       [8]               [143]     [144] 
setosa    setosa    setosa    setosa    setosa    setosa    setosa    setosa            : virginica virginica 
    [145]     [146]     [147]     [148]     [149]     [150] 
virginica virginica virginica virginica virginica virginica

但是，例如，如果我想对字符 1 到 3 进行子字符串化，则会出现以下错误：

> substr(as.character(A$Species),1,3)
Error in substr(as.character(A$Species), 1, 3) : 
  extracting substrings from a non-character object

修改 ffdf 对象中的列有哪些准则？

编辑

我也尝试了 ffdfdply 方法。对于一个相当小的数据来说似乎需要很长时间：

substrff <- function(x){
  x$new <- substr(x$Species,1,8)
  return(x)
}

B <-  ffdfdply(x=A, split = A$Species, FUN = substrff)

Answer 1

require(ffbase)
data(iris, package = "datasets")
x <- as.ffdf(iris)
x$spec <- with(x[c("Species")], substr(Species, 1, 4))

将值重新分配给 ffdf [R] 中的列

Reassigning values to columns in ffdf [R]

r

ff

ffbase