ode 求解器中的 matlab for 循环

Question

我正在使用 ODE 求解器来求解我的 ODE 系统。现在我还想通过改变它们来计算各种参数的灵敏度。我的基本 ODE 求解器程序类似于：函数：

function F = ODE_site(t,y)
%%Parameter block
k1f=1e8;
k1b=1e5; %%and so on

%%Elementary rate block
r1=k1f*y(1)-k1b*P*y(5);
and so on

%%Mass balance block
F=[  r1-r5-r78+r86 ;
    and so on ];
%% End of function

主要的 ODE 求解器如下所示：

optode = odeset('NonNegative',1:41,'Abstol',1E-20,'RelTol',1E-20);
y0=zeros(41,1);
y0(41) = 1;
[t,y]=ode15s(@ODE_site,[0,50000000000],y0,optode);
%% Plus some other lines to plot the solution
%% End of ODE solver

现在，我想在主求解器中引入一个 for 循环，但问题是如果我在主求解器中使用 for 循环，它无法将命令传递给函数。我尝试使用 global 将变量分配给整个环境，但它没有用。如何为 ODE 求解器代码和函数分配 for 循环？任何帮助将不胜感激。谢谢，马蒙

Answer 1

定义要修改为函数的附加输入参数的参数：

function F = ODE_site(t,y,param)
%%Parameter block
k1f=param(1);
k1b=param(2); %%and so on

%%Elementary rate block
r1=k1f*y(1)-k1b*P*y(5);
and so on

%%Mass balance block
F=[  r1-r5-r78+r86 ;
    and so on ];
%% End of function

您可以在优化后的ode15()中将参数交给您的函数参数：

optode = odeset('NonNegative',1:41,'Abstol',1E-20,'RelTol',1E-20);
y0=zeros(41,1);
y0(41) = 1;
para=[1e5, 1e8]
[t,y]=ode15s(@ODE_site,[0,50000000000],y0,optode,para);

两个注意事项：

*) 代码未经测试。由于您的示例不可执行，因此我也不想制作运行示例。

*) 看起来你在解决化学反应动力学问题。您很可能可以通过使用矩阵和向量运算进一步优化您的代码。因此，与其使用单独的变量 r1, r2, r3, .. 你可以将它存储在一个向量中 r(1), r(2), r(3), ... 你的最后一行，可以写成反应向量与化学计量矩阵的乘积。

ode 求解器中的 matlab for 循环

matlab for loop within ode solver

matlab

ode