读取 R 中的多个文件 - TAB 分隔文件

Question

我想修改下面的代码，它读取几个 .csv（逗号分隔值）文件，以通知它这些文件是制表符分隔的，即 .tsv 文件。

temp = list.files(pattern="*.csv")
myfiles = lapply(temp, read.delim)

对于单个文件，我做了（使用 readr 包）：

data_1  <- readr::read_delim("dataset_1.csv", "\t", escape_double = FALSE, trim_ws = TRUE)

有什么帮助吗？谢谢，

里卡多

Answer 1

我猜你要找的是以下内容：

版本 1：用户定义函数

my_read_delim <- function(path){
  readr::read_delim(path, "\t", escape_double = FALSE, trim_ws = TRUE)
}
lapply(temp, my_read_delim)

版本 2：使用 lapply
的 ... 参数 lapply 有第三个参数 ...，这意味着第二个参数之后的参数被传递给指定为第二个参数的函数：

lapply(temp, readr::read_delim, delim = "\t", escape_double = FALSE, trim_ws = TRUE)

版本二与版本一基本相同，但更紧凑

假设所有文件都具有相同的列：

在大多数应用程序中，在通过 read_delim 读取数据后，您想要 rbind 它们。您可以使用 purrr 包中的 map_df 来简化它，如下所示：

require(purrr)
require(readr)
# or require(tidyverse)

temp <- list.files(pattern="*.csv")
map_df(temp, read_delim, delim = "\t", escape_double = FALSE, trim_ws = TRUE)

读取 R 中的多个文件 - TAB 分隔文件

Read Several Files in R - TAB Delimited Files

csv

r

readr