如何获取 statsmodels / patsy 公式所依赖的列?
How do I get the columns that a statsmodels / patsy formula depends on?
假设我有一个 pandas
数据框:
df = pd.DataFrame({'x1': [0, 1, 2, 3, 4],
'x2': [10, 9, 8, 7, 6],
'x3': [.1, .1, .2, 4, 8],
'y': [17, 18, 19, 20, 21]})
现在我使用公式拟合 statsmodels
模型(在幕后使用 patsy
):
import statsmodels.formula.api as smf
fit = smf.ols(formula='y ~ x1:x2', data=df).fit()
我想要的是 fit
所依赖的 df
的列列表,以便我可以在另一个数据集上使用 fit.predict()
。例如,如果我尝试 list(fit.params.index)
,我会得到:
['Intercept', 'x1:x2']
我已经尝试重新创建 patsy 设计矩阵,并使用 design_info
,但我仍然只能得到 x1:x2
。我想要的是:
['x1', 'x2']
甚至:
['Intercept', 'x1', 'x2']
我怎样才能从 fit
对象中得到这个?
predict
采用相同的数据框或字典结构,调用 patsy 以兼容的方式对其进行转换。要复制这个你也可以检查statsmodels.base.model.Results.predict
中的代码,其核心是
exog = dmatrix(self.model.data.design_info.builder,
exog, return_type="dataframe")
公式信息本身存储在design_info
中terms
的描述中。变量名称本身在 summary()
中使用,并作为返回的 pandas 系列中的索引,例如在 results.params
.
中
简单测试列名是否出现在公式的字符串表示中:
ols = smf.ols(formula='y ~ x1:x2', data=df)
fit = ols.fit()
print([c for c in df.columns if c in ols.formula])
['x1', 'x2', 'y']
还有一种方法是重建 patsy 模型(更冗长,但也更可靠),它不依赖于原始数据框:
md = patsy.ModelDesc.from_formula(ols.formula)
termlist = md.rhs_termlist + md.lhs_termlist
factors = []
for term in termlist:
for factor in term.factors:
factors.append(factor.name())
print(factors)
['x1', 'x2', 'y']
ols.exog_names
和 ols.endog_names
应该这样做
假设我有一个 pandas
数据框:
df = pd.DataFrame({'x1': [0, 1, 2, 3, 4],
'x2': [10, 9, 8, 7, 6],
'x3': [.1, .1, .2, 4, 8],
'y': [17, 18, 19, 20, 21]})
现在我使用公式拟合 statsmodels
模型(在幕后使用 patsy
):
import statsmodels.formula.api as smf
fit = smf.ols(formula='y ~ x1:x2', data=df).fit()
我想要的是 fit
所依赖的 df
的列列表,以便我可以在另一个数据集上使用 fit.predict()
。例如,如果我尝试 list(fit.params.index)
,我会得到:
['Intercept', 'x1:x2']
我已经尝试重新创建 patsy 设计矩阵,并使用 design_info
,但我仍然只能得到 x1:x2
。我想要的是:
['x1', 'x2']
甚至:
['Intercept', 'x1', 'x2']
我怎样才能从 fit
对象中得到这个?
predict
采用相同的数据框或字典结构,调用 patsy 以兼容的方式对其进行转换。要复制这个你也可以检查statsmodels.base.model.Results.predict
中的代码,其核心是
exog = dmatrix(self.model.data.design_info.builder,
exog, return_type="dataframe")
公式信息本身存储在design_info
中terms
的描述中。变量名称本身在 summary()
中使用,并作为返回的 pandas 系列中的索引,例如在 results.params
.
简单测试列名是否出现在公式的字符串表示中:
ols = smf.ols(formula='y ~ x1:x2', data=df)
fit = ols.fit()
print([c for c in df.columns if c in ols.formula])
['x1', 'x2', 'y']
还有一种方法是重建 patsy 模型(更冗长,但也更可靠),它不依赖于原始数据框:
md = patsy.ModelDesc.from_formula(ols.formula)
termlist = md.rhs_termlist + md.lhs_termlist
factors = []
for term in termlist:
for factor in term.factors:
factors.append(factor.name())
print(factors)
['x1', 'x2', 'y']
ols.exog_names
和 ols.endog_names
应该这样做