如何检查分子动力学中粒子之间的重叠
How to check overlap between to particle in Molecular Dynamics
假设我有10个粒子，每个粒子有三个坐标。我想随机放置它们，使两个粒子之间的距离始终大于某个值（比如 1）。
知道如何做到这一点。
因为你没有提到粒子被限制在某个体积内，即它们可以在 R^3 中的任何地方，你可以只引入随机数
n = 10
pos = np.random.random(3*n).reshape(n,3)
然后计算所有成对距离，请参阅 了解如何有效地执行此操作，然后将整个数组 pos 除以最小距离（如果您使用值 1 是任何两个粒子都不应小于的距离）。
假设我有10个粒子，每个粒子有三个坐标。我想随机放置它们，使两个粒子之间的距离始终大于某个值（比如 1）。 知道如何做到这一点。
因为你没有提到粒子被限制在某个体积内，即它们可以在 R^3 中的任何地方，你可以只引入随机数
n = 10
pos = np.random.random(3*n).reshape(n,3)
然后计算所有成对距离，请参阅 pos 除以最小距离（如果您使用值 1 是任何两个粒子都不应小于的距离）。