随机效应和固定效应之间的 3 种交互作用
3 way interaction between random and fixed effects
我有一组数据如下所示:
rep stage line temp surv
1 L 149 18 0.6
2 L 149 18 0.7
3 L 149 18 0.25
1 A 149 18 1
2 A 149 18 1
3 A 149 18 1
1 L 149 25 0
2 L 149 25 0.2
3 L 149 25 0.3
1 A 149 25 1
2 A 149 25 1
3 A 149 25 1
1 L 208 18 0.6
2 L 208 18 0.4
3 L 208 18 0.55
1 A 208 18 1
2 A 208 18 1
3 A 208 18 1
1 L 208 25 0
2 L 208 25 0.05
3 L 208 25 0.05
1 A 208 25 1
2 A 208 25 0.857142857
3 A 208 25 0.7
其中rep是replicate,stage是我正在研究的果蝇的生命阶段(L=幼虫,A=成虫),line是遗传系的编号分配,temp是饲养温度,surv是存活的比例。
我想做的是,使用 R 中的 lme4 包,将 3 向交互模型(线性混合模型)拟合到 运行 方差分析。我的原始模型:
surv_3w.aov<-lmer(surv~stage*line*temp + (1|rep), data=dat_3w)
有效,但我想将线条视为随机效果。我认为我正确地将 rep 视为分组变量,(1|rep)
,但我不确定。
我试过这个模型:
surv_3w.aov<-lmer(surv~stage*temp*(1|line) + (1|rep), data=dat_3w)
但是我的三向交互消失了。
基本上,我正在寻求帮助,在线路、阶段和临时之间建立一个三向交互模型,其中线路是随机的,rep 是一个分组变量
重复很多类似的问题,但 this 例如。
您要求的 3 向交互模型的代码是:
surv_3w.aov<-lmer(surv~stage*line*temp + (1 + line |rep), data=dat_3w)
这是否真的是你需要的,我不知道。
我有一组数据如下所示:
rep stage line temp surv
1 L 149 18 0.6
2 L 149 18 0.7
3 L 149 18 0.25
1 A 149 18 1
2 A 149 18 1
3 A 149 18 1
1 L 149 25 0
2 L 149 25 0.2
3 L 149 25 0.3
1 A 149 25 1
2 A 149 25 1
3 A 149 25 1
1 L 208 18 0.6
2 L 208 18 0.4
3 L 208 18 0.55
1 A 208 18 1
2 A 208 18 1
3 A 208 18 1
1 L 208 25 0
2 L 208 25 0.05
3 L 208 25 0.05
1 A 208 25 1
2 A 208 25 0.857142857
3 A 208 25 0.7
其中rep是replicate,stage是我正在研究的果蝇的生命阶段(L=幼虫,A=成虫),line是遗传系的编号分配,temp是饲养温度,surv是存活的比例。
我想做的是,使用 R 中的 lme4 包,将 3 向交互模型(线性混合模型)拟合到 运行 方差分析。我的原始模型:
surv_3w.aov<-lmer(surv~stage*line*temp + (1|rep), data=dat_3w)
有效,但我想将线条视为随机效果。我认为我正确地将 rep 视为分组变量,(1|rep)
,但我不确定。
我试过这个模型:
surv_3w.aov<-lmer(surv~stage*temp*(1|line) + (1|rep), data=dat_3w)
但是我的三向交互消失了。
基本上,我正在寻求帮助,在线路、阶段和临时之间建立一个三向交互模型,其中线路是随机的,rep 是一个分组变量
重复很多类似的问题,但 this 例如。
您要求的 3 向交互模型的代码是:
surv_3w.aov<-lmer(surv~stage*line*temp + (1 + line |rep), data=dat_3w)
这是否真的是你需要的,我不知道。