将列表与 do.call 组合，同时将列表的每个条目保留在一行中

Question

如果之前有人问过，请原谅我...

我有多个列表想按如下方式合并

A <- list(c("R", "L", "*", "T", "M", "S", "S", "S", "S", "Y"), 
  c("G", "A", "G", "P", "P", "V", "P"), 
  c("E", "G", "R", "E", "Q", "T", "K", "G", "S", "G"), 
  c("Y", "N", "N", "D", "W"), 
  c("T", "K"))

B <- list(c("G", "T", "Q", "R"), 
  c("T", "G", "L", "W", "D", "Y", "*", "L", "Q", "H", "A", "P", "H", "L", "H", "L"), 
  c("E", "E", "D", "A", "G", "G", "R", "E", "D", "S", "I", "L", "V", "N", "G", "A", "T", "P", "\"", "\"", "C", "S", "D", "Q", "S", "S", "D", "S", "P", "P", "I", "L", "E", "A", "I", "R"), 
  c("S", "M", "C", "G", "*", "I", "K", "P"), 
  c("D", "S", "P"))

C <- list(c("G", "L", "V", "L", "A", "H", "L", "R", "R", "L", "G"), 
  c("G", "S", "D", "T", "P", "V", "M", "P", "K", "L", "F"), 
  c("N", "W", "F", "E", "N", "T", "F", "D", "F", "R", "N", "K", "R", "C", "K", "*", "V"), 
  c("P", "A", "T", "R", "S", "L", "R", "R", "R", "A", "T", "A"), 
  c("I", "G", "F", "I", "P", "S", "P", "L", "R"))

我要的是这个：

A           B                                       C
RL*TMSSSSY  GTQR                                    GLVLAHLRRLG
GAGPPVP     TGLWDY*LQHAPHLHL                        GSDTPVMPKLF 
EGREQTKGSG  EEDAGGREDSILVNGATP""CSDQSSDSPPILEAIR    NWFENTFDFRNKRCK*V
YNNDW       SMCG*IKP                                PATRSLRRRATA
TK          DSP                                     IGFIPSPLR

我尝试了以下方法，但这会将列表的每个字符放在不同的行上，相当于每个列表的不同行数：

do.call(cbind, list(A,B,C))

有没有办法得到我想要的？

感谢

Answer 1

我们可以使用嵌套的 sapply 来遍历 list

 m1 <- sapply(list(A, B, C), function(x) sapply(x, paste, collapse=""))
 setNames(as.data.frame(m1), LETTERS[1:3])

Answer 2

这是一种基本的 R 方法。

data.frame(do.call(mapply,
                   list(function(x) sapply(x, paste, collapse=""), list(A=A, B=B, C=C))))

这个returns

           A                                    B                 C
1 RL*TMSSSSY                                 GTQR       GLVLAHLRRLG
2    GAGPPVP                     TGLWDY*LQHAPHLHL       GSDTPVMPKLF
3 EGREQTKGSG EEDAGGREDSILVNGATP""CSDQSSDSPPILEAIR NWFENTFDFRNKRCK*V
4      YNNDW                             SMCG*IKP      PATRSLRRRATA
5         TK                                  DSP         IGFIPSPLR

这里，do.call适用Map。第二行中的列表是 Map 的参数，它在列表的命名列表上应用 sapply。 sapply 粘贴每个列表项的矢量和 returns 一个矢量。

备注：

这是对 alexis-laz 之前向我展示的方法的复制尝试。
我最初使用 Map，但根据 microbenchmark，mapply 似乎快了大约 33%（344 毫秒对 513 毫秒）。

Answer 3

如果你想使用tidyverse函数，你可以

library(tidyverse)
lst(A,B,C) %>% map_df(map_chr, paste, collapse="")

lst() 函数允许使用创建列表并保留变量名。然后我们 map() 遍历列，并在每一列中 map() 遍历字符向量列表并折叠它们。

将列表与 do.call 组合，同时将列表的每个条目保留在一行中

Combining lists with do.call while preserving each entry of the list on a row

r

list

do.call

cbind