如何使用 Voro++ 库获取容器中所有单元格的顶点？

Question

我尝试用 Voro++ 实现一个简单的 3d voronoi 应用程序。我有一个装有颗粒的容器。将所有粒子放入容器后，如何获取Voro++计算出的所有voronoicells的顶点。

Answer 1

从文档来看应该是这样的： http://math.lbl.gov/voro++/examples/polygons/

文档说：在第 47 行，调用了 face_vertices 例程，其中 returns 有关哪些顶点构成每个面的信息。它是一个具有特定格式的整数向量：第一个条目是一个数字 k，对应于构成一个面的顶点数，接下来的 k 个附加条目描述了哪些顶点构成了这个面。例如，序列 (3, 16, 20, 13) 对应于将顶点 16、20 和 13 连接在一起的三角形面。在第 48 行，返回顶点位置：这对应于描述每个顶点位置的三元组向量 (x, y, z)。

我修改了示例脚本，以便它在向量中存储每个粒子单元连接和顶点位置。但请验证这一点！希望这对您有所帮助！

#include "voro++.hh"
#include "container.hh"
#include <v_compute.hh>
#include <c_loops.hh>
#include <vector>
#include <iostream>

 using namespace voro;

int main() {

    // Set up constants for the container geometry
    const double x_min=-5,x_max=5;
    const double y_min=-5,y_max=5;
    const double z_min=0,z_max=10;

    unsigned int i,j;
    int id,nx,ny,nz;
    double x,y,z;
    std::vector<int> neigh;
    voronoicell_neighbor c;

    // Set up the number of blocks that the container is divided into
    const int n_x=6,n_y=6,n_z=6;

    // Create a container with the geometry given above, and make it
    // non-periodic in each of the three coordinates. Allocate space for
    // eight particles within each computational block
    container con(x_min,x_max,y_min,y_max,z_min,z_max,n_x,n_y,n_z,
                 false,false,false,8);

    //Randomly add particles into the container
    con.import("pack_six_cube");

    // Save the Voronoi network of all the particles to text files
    // in gnuplot and POV-Ray formats
    con.draw_cells_gnuplot("pack_ten_cube.gnu");
    con.draw_cells_pov("pack_ten_cube_v.pov");

    // Output the particles in POV-Ray format
    con.draw_particles_pov("pack_ten_cube_p.pov");

    // Loop over all particles in the container and compute each Voronoi
    // cell
    c_loop_all cl(con);
    int dimension = 0;
    if(cl.start()) do if(con.compute_cell(c,cl)) {
        dimension+=1;
    } while (cl.inc());

    std::vector<std::vector<int> > face_connections(dimension);
    std::vector<std::vector<double> > vertex_positions(dimension);

    int counter = 0;

    if(cl.start()) do if(con.compute_cell(c,cl)) {
        cl.pos(x,y,z);id=cl.pid();

        std::vector<int> f_vert;
        std::vector<double> v;

        // Gather information about the computed Voronoi cell
        c.neighbors(neigh);

        c.face_vertices(f_vert);
        c.vertices(x,y,z,v);

        face_connections[counter] = f_vert;
        vertex_positions[counter] = v;

        std::cout << f_vert.size() << std::endl;
        std::cout << v.size() << std::endl;

        counter += 1;
      } while (cl.inc());


}

此致，卢卡斯

如何使用 Voro++ 库获取容器中所有单元格的顶点？

How can I get the vertices of all cells in a container with Voro++ Library?

c++

3d

voronoi