在 igraph 上绘制邻居的问题

Question

我确定了所选节点的邻居，但无法绘制结果。以下面的例子，是从另一个问题中复制过来的：

edgelist <- read.table(text = "
A B
B C
C D
D E
C F
F G")

library(igraph)
graph <- graph.data.frame(edgelist)
str(graph)
#IGRAPH DN-- 7 6 -- 
# + attr: name (v/c)
# + edges (vertex names):
# [1] A->B B->C C->D D->E C->F F->G

我将 "D" 的邻居识别为：

neighborsD <- neighbors(graph, "D")

但是当我指示 R 绘图时 "neighborsD"...

plot(neighborsD)

...我得到的是图表而不是社会关系图，当我尝试对其进行 tkplot 时，出现错误 "not a graph object"。那么两个问题：

1) 如何围绕 "D" 绘制网络？

2) 如何绘制“D”、它的邻居以及邻居的邻居（距离 "D" 两步？

Answer 1

使用ego()函数查找距离a节点一定距离的节点。然后使用 induced_subgraph 对主图进行子集化。例如1步之遥的是

plot(induced_subgraph(graph, ego(graph, 1, "D")[[1]]))

两步之遥的是

plot(induced_subgraph(graph, ego(graph, 2, "D")[[1]]))

在 igraph 上绘制邻居的问题

Issue with plotting neighbors on igraph

plot

r

igraph