networkx 中边缘列表的自定义输出

Question

我正在尝试实施 tarjan 的算法进行练习。我决定生成一个随机图作为算法的输入，一次添加一条边。

我生成了随机图并保存在文件中，如下图

from networkx import *
import sys
import matplotlib.pyplot as plt

n = 10  # 10 nodes
m = 20  # 20 edges

G = gnm_random_graph(n, m)

# print the adjacency list to a file
try:
    nx.write_edgelist(G, "test.edgelist", delimiter=',')
except TypeError:
    print "Error in writing output to random_graph.txt"

fh = open("test.edgelist", 'rb')
G = nx.read_adjlist(fh)
fh.close()

我在 test.edgelist 文件中得到的输出是这样的。

0,4,{}
0,5,{}
0,6,{}
1,8,{}
1,3,{}
1,4,{}
1,7,{}
2,8,{}
2,3,{}
2,5,{}
3,8,{}
3,7,{}
4,8,{}
4,9,{}
5,8,{}
5,9,{}
5,7,{}
6,8,{}
6,7,{}
7,9,{}

然而，在我实现的 tarjan 算法中，输入的格式为

add_edge(1,2)
add_edge(2,3)
....

我希望在循环中使用随机生成的图形作为输入。

我怎么没有得到 {}？另外，如果有更好的方法来实现这个，请帮忙，因为对于一个庞大的数据集，很难将它保存在一个列表中（add_edge() 将边缘添加到列表中）

Answer 1

您必须通过将 data 参数设置为 False:

来删除所有边缘数据

nx.write_edgelist(G, "test.edgelist", delimiter=',', data = False)

输出：

0,3
0,4
0,1
0,8
0,6
0,7

但是，如果您想以自己的格式保存边缘，请使用如下循环：

from networkx import gnm_random_graph

n = 10  # 10 nodes
m = 20  # 20 edges

G = gnm_random_graph(n, m)

# iterate over all edges
with open('./test.edgelist', 'w') as f:
    for edge in G.edges():
        f.write("add_edge{0}\n".format(edge))

输出：

add_edge(0, 7)
add_edge(0, 4)
add_edge(0, 8)
add_edge(0, 3)
add_edge(0, 2)
add_edge(1, 5)
add_edge(1, 6)
add_edge(1, 7)
add_edge(2, 5)
add_edge(2, 4)
add_edge(2, 9)
add_edge(2, 8)
add_edge(2, 3)
add_edge(3, 9)
add_edge(3, 5)
add_edge(4, 9)
add_edge(4, 7)
add_edge(5, 9)
add_edge(6, 9)
add_edge(7, 9)

networkx 中边缘列表的自定义输出

Custom output of edgelist in networkx

python

graph

graph-algorithm

networkx

strongly-connected-graph