当使用 sql 块分配数据帧时，R 笔记本不会编织

Question

我有一个 R 笔记本，我在其中使用 sql 块从数据库中读取数据，然后将其分配给数据框。然后我想在 R 笔记本中的 R 块中使用它，所以我在 sql 块中使用 output.vars 选项。

当我运行 all 然后预览它完美地工作但是当我编织它时我得到错误："Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'x' not found".

以下是一些可以重现此错误的简单代码：

---
title: "R Notebook"
output:
  html_notebook: default
  html_document: default
---

```{r setup}
library(DBI)
library(RSQLite)
db = dbConnect(SQLite(), dbname = "C:/R/chinook.db")
```

```{sql connection = db, output.vars = 'x'}
SELECT * FROM artists
```

```{r}
x[1:10,]
```

我正在使用：

R 版本 3.4.0 (2017-04-21)
平台：i386-w64-mingw32/i386（32 位）
运行下：Windows 7 x64（内部版本 7601）Service Pack 1
RStudio 1.0.143
DBI_0.6-1
knitr_1.15.1

该示例使用来自 sqlitetutorial.net http://www.sqlitetutorial.net/download/sqlite-sample-database/?wpdmdl=94.

的 SQLite 示例数据库

我也尝试过不同类型的数据库，但都没有成功。

Answer 1

我不确定中间的语法块是否有效。你为什么不喜欢：

```{r}
library(DBI)
library(RSQLite)
db <- dbConnect(SQLite(), dbname = "C:/R/chinook.db")
x <- dbGetQuery(db, 'SELECT * FROM artists')

```

```{r}
x[1:10,]
```

Answer 2

我认为你必须将 output.vars 更改为 output.var

```{sql connection = db, output.var = 'x'}
SELECT * FROM artists
```

对我来说很管用。

当使用 sql 块分配数据帧时，R 笔记本不会编织

R notebook won't knit when data frame has been assigned from with sql chunk

r

r-dbi

rnotebook