通过 rpy2 将列表作为参数传递

Question

我在 Python 中使用 R 的 spi 函数。其中一个参数 ("kernel") 需要一个列表，我不确定在使用 rpy2 时如何传递它。 R 语法如下（with "kernel" 参数）：

library("lmomco", lib.loc="~/lib/R_libs")
library("SPEI", lib.loc="~/lib/R_libs")

data = read.csv("rainfall_data.csv", header = FALSE)
result = spi(data, scale=10, distribution='Gamma', fit='max-lik', kernel = list(type='rectangular', shift=0))

我的 Python 脚本（没有使用 "kernel" 参数）如下：

import numpy as np 
from rpy2.robjects.packages import importr
importr('lmomco')
SPEI = importr('SPEI')

import rpy2.robjects.numpy2ri as numpy2ri
numpy2ri.activate()

data = np.genfromtxt('rainfall_data.csv', delimiter=',')

result = np.array(SPEI.spi(data, scale=10, distribution='Gamma', fit='max-lik')[1])

如何将内核作为 rpy2 的列表传递？

Answer 1

考虑从 python 字典创建 ListVector，然后将其传递给方法：

import rpy2.robjects as robjects 
...
x = robjects.ListVector({'type': 'rectangular', 'shift': 0})

result = np.array(SPEI.spi(data, scale=10, distribution='Gamma', fit='max-lik', kernel=x)[1])

通过 rpy2 将列表作为参数传递

passing list as argument though rpy2

python

r

rpy2