"RcppArmadilloExtensions/sample.h" R 包构建步骤中的链接器错误

Question

我正在制作一个 R 包，它在某些源文件中使用了 Rcpp::RcppArmadillo::sample() 函数。特别是，我在 4 个不同的 cpp 文件中使用了该函数，并且在每个文件中我都添加了这一行 #include <RcppArmadilloExtensions/sample.h> 以包含所需的头文件。

一切正常，直到我想通过命令 R CMD build mypackage 构建包。我收到 duplicate symbol 错误，其中提到的头文件中定义的大多数函数都被列为重复符号。例如，ProbSampleNoReplace、FixProb、SampleReplace 和 WalkerProbSampleReplace 等函数都被列为在这 4 个 cpp 文件之间重复。

我搜索了这个问题，解决方案是在 .cpp 文件而不是 .h 文件中定义变量或函数以防止重复，如果需要，请使用 extern在任何其他 cpp 文件中使用这些变量。但我认为该解决方案不适用于此处，因为头文件不是我编写的，我不想对位于 here.

的 sample.h 头文件进行任何更改

有什么解决这个问题的建议吗？预先感谢您的帮助。

Answer 1

根据德克的评论，这最终对我有用：

我删除了每个文件顶部多余的 headers 并将其放在一个地方。这可以通过两种方式完成。一种是放在一个访问函数中，可以在任何需要的地方调用。

另一种选择是，如果您的整个项目不是那么大，您可以将 header #include <RcppArmadilloExtensions/sample.h> 放在主 .cpp 文件之上，其中包含您的项目与多个职能。我实际上为我自己的项目做了后一种选择。

Answer 2

我能够使用@amir-nik 在他 2021 年 6 月 16 日的回答中陈述的第一个选项。

One is to put it in one access function that can be called anywhere needed.

由于我花了很长时间才弄清楚如何去做，所以我在这里提供了一个完整的示例，以防大家感兴趣。

首先，我制作了如下源文件sample.cpp。重载是因为我需要采样函数来处理两种不同的向量类型。

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
arma::vec sample(const arma::vec& x, const int& size, const bool& replace, const arma::vec& probs){
  return Rcpp::RcppArmadillo::sample(x, size, replace, probs);
}
arma::uvec sample(const arma::uvec& x, const int& size, const bool& replace, const arma::vec& probs){
  return Rcpp::RcppArmadillo::sample(x, size, replace, probs);
}

接下来，我制作了这个头文件sample.h：

#ifndef SAMPLE_H
#define SAMPLE_H

#include <RcppArmadillo.h>
arma::vec sample(const arma::vec& x, const int& size, const bool& replace, const arma::vec& probs);
arma::uvec sample(const arma::uvec& x, const int& size, const bool& replace, const arma::vec& probs);
#endif

现在，通过编写 #include "sample.h"，我可以在我的所有代码中使用 Rcpp::RcppArmadillo::sample()。

"RcppArmadilloExtensions/sample.h" R 包构建步骤中的链接器错误

"RcppArmadilloExtensions/sample.h" Linker Error in R Package Build Step

armadillo

rcpp

r-package