R，加载 rJava 错误

Question

我是运行 macOS sierra (10.12.5) 上的 R（版本 3.4.0），我正在尝试使用需要使用 rJava 库的 xlsx 库。

当我尝试在 R 控制台中使用 library(rJava) 加载 rJava 时（在 RStudio 或终端中没有区别），我收到以下错误消息，我无法理解：

Fehler: package or namespace load failed for ‘rJava’:
 .onLoad in loadNamespace() für 'rJava' fehlgeschlagen, Details:
  Aufruf: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  Fehler: kann shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so' nicht laden:
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
  Reason: image not found

谷歌搜索这个问题我发现很多帖子有点相似（但每次的问题都略有不同），是其中最有希望的。

由于建议的步骤需要适应我的情况，而且我是新手，所以我无法实施它们。我能做什么？

附加信息：

shell命令java -versionreturns:

java version "1.8.0_131"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_131-b11)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.131-b11, mixed mode)

和shell命令R CMD javareconf returns:

Java interpreter : /usr/bin/java
Java version     : 1.8.0_131
Java home path   : /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre
Java compiler    : /usr/bin/javac
Java headers gen.: /usr/bin/javah
Java archive tool: /usr/bin/jar
Non-system Java on macOS

trying to compile and link a JNI program 
detected JNI cpp flags    : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/darwin
detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
clang -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/../include -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/../include/darwin  -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2  -c conftest.c -o conftest.o
clang -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -    L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o conftest.so conftest.o -L/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/lib/server -ljvm -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation


JAVA_HOME      /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre
Java library path: $(JAVA_HOME)/lib/server
JNI cpp flags    : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/darwin
JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
Updating Java configuration in /Library/Frameworks/R.framework/Resources
Done.

任何帮助将不胜感激！

Answer 1

有效！

安装和重新安装不同的 java 版本并使用 R 命令重新安装 rJava 后 install.packages("rJava") 我到了在 R 控制台加载库的地步 (shell window) 不再抛出错误信息。

之后，我能够使用中的答案通过运行这个 shell 命令使其在 RStudio 中工作：

sudo ln -f -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib

毕竟不是太复杂！感谢大家的耐心等待。

Answer 2

JAVA_HOME MAC OS 不同版本的路径不同。在某些情况下，有 /jre 文件夹，在某些情况下，在 /Home 导演手动进入 /server 文件夹后，在终端中使用 CD 命令并使用 pwd 复制整个路径使用它来设置 java.home 然后你可以轻松加载 rJava 库。这就是我解决问题的方法

options("java.home"="/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.0.1.jdk/Contents/Home/lib")

Sys.setenv(LD_LIBRARY_PATH='$JAVA_HOME/server')

dyn.load('/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib')

library(rJava)

R，加载 rJava 错误

R, loading rJava error

java

r

rjava