在 Bokeh 中更改和弦图的调色板

Question

我正在使用 Bokeh 库生成和弦图。该图本身或多或少生成得很好，但我很难弄清楚如何更改调色板。据我所知，Bokeh 中的大多数图表都可以有一个可选的 palette 参数，但添加它不会改变调色板。我错过了什么吗？

import bokeh
from bokeh.charts import Chord
from bokeh.io import show, output_file
from bokeh.palettes import inferno

chord_diagram = Chord(forchord, source='nameA', target='nameB', palette= inferno(256))
show(chord_diagram)

如果一些数据有帮助：

nameA_lst = ['Creb5','Creb5','JDP2(var.2)','JDP2(var.2)',
             'Creb5','JDP2(var.2)','ATF7','ATF','ATF7','Creb5']
nameB_lst = ['STAT3','STAT1','STAT3','STAT1','Stat4',
             'Stat4','STAT3','STAT1','Stat4','Stat5a::Stat5b']
forchord = pd.DataFrame({'nameA': nameA_lst, 'nameB': nameB_lst})
forchord.head()
    nameA   nameB
0   Creb5   STAT3
1   Creb5   STAT1
2   JDP2(var.2) STAT3
3   JDP2(var.2) STAT1
4   Creb5   Stat4

Answer 1

Chord 不使用调色板，它使用这样的色轮：

Answer 2

接受的答案有点过时，因为 bokeh.charts 已被弃用（), instead you can use Holoviews which use colormaps, as described here: http://holoviews.org/user_guide/Colormaps.html

在 Bokeh 中更改和弦图的调色板

Change palette for Chord Diagram in Bokeh

python

visualization

graph

bokeh

chord-diagram