python 中是否存在用于执行 RWR（重启后随机游走）的程序包

Question

在python中是否有一些包或函数可以计算 RWR？ 我想使用加权图计算 RWR。 但我在 python 中找不到 RWR 包。 请告诉我包名是否存在于 python 中。 或者请在 python 中查看一些示例 RWR。 谢谢。

Answer 1

我建议您从这里开始：SciPy Cookbook » Other examples » Brownian Motion。

如果您真的在寻找一个全面的软件包，您可能想要查看 MMTK。但老实说，这可能不是您想要的（因为它更多地来自分子动力学方法）。没有随机游走的库，原因很简单，随机微分方程的积分器很容易写成 3 行（通过从正态分布中抽取随机数并在每一步中添加它们）。