你能通过 R 安装一个 Python 包吗 - Reticulate

Question

我将要在 R 中使用包 Reticulate 创建一个 python 界面。为了访问 R 中的 python 函数，需要安装相应的 python 包。

我想到了两个问题：

1) 如果使用reticulate包，需要安装Anaconda包吗？还是仅安装 python 个软件包就足够了？

2) 是否可以在 R 中安装 python 包，类似于 install.packages("r_package")？

有人有这方面的经验吗？提前致谢！

Answer 1

1) R 包 reticulate 可以使用默认的 python 或 Anaconda2 或 Anaconda3。如果你想让 Anaconda 与 R 一起工作，你必须先安装 Anaconda。安装后，调用 library(reticulate) 和运行 py_config() 或 reticulate::py_discover_config()，这将为您提供 Python 安装使用的路径和环境列表。然后，一旦您知道了 Python 路径，就可以在 library(reticulate) 之后添加这样一行 use_python("/opt/miniconda2/bin/python")，您就可以开始工作了。

2) 要安装 Python 包以便 R（或网状）可以看到它们，您必须从终端或控制台将它们作为常规 Python 包安装；不是 R。示例：conda install numpy 安装 numpy，或 conda install scipy 安装 scipy，等等。

我只是在 Docker 容器 rocker/rstudio 中完成所有这些工作。在标准 OS.

中应该更容易

这里是分步说明：rstudio reticulate

干杯！

Answer 2

我将在之前的答案中添加一些细微差别。

正如@f0nzie 所说，Anaconda 不是一个包，而是一个包管理器。理想情况下，您将使用 Anaconda 创建一个环境来协助您进行包管理和版本控制。 conda 环境的文档是 here.

现在，您可以将 python 包安装到 R 中的 anaconda 包中。这可以使用 reticulate::conda_install(envname, packages)。 conda_install() 的文档可以在 here.

中找到

Answer 3

如果您需要特定版本的 Python 模块，请在模块名称后放置 ==，例如以下将使用 pip 安装 3 个模块的特定版本：

reticulate::conda_install(c("PyMuPDF==1.14.20", "PyPDF2==1.26.0", "reportlab==3.5.23"),
                            envname = "myenv", pip = TRUE)

你能通过 R 安装一个 Python 包吗 - Reticulate

Can you install a Python package via R - Reticulate

python

r

interface

reticulate