生成了错误的树状图

Question

我有31个数据，但是dendrogram少了一个数据。这是我的代码：

A = csvread('similarityNoGrpS2.csv',1,1) % 31x31 double
Z = linkage(A, 'average') % 30x3 double
H = dendrogram(Z,'Orientation','left','ColorThreshold','default') %29x1 line

可以找到我的输入文件here。

这是我的 dendrogram:

根据Z，(24,30)和(27,31)应该是聚类的，但是在dendrogram图中，我们可以看到没有31和27 与 30 聚集在一起，这是错误的！

谁能帮我解决这个问题？

P.S。我正在使用 MATLAB R2016a。

Answer 1

您需要将代码的最后一行修改为：

H = dendrogram(Z, 0, 'Orientation', 'left', 'ColorThreshold', 'default');

对于给定的数据给出：

---

说明

您的原始数据集（A）有超过30个点但您没有指定P 的值。 documentation:

中提到

If you do not specify P then dendrogram uses 30 as the maximum number of leaf nodes. To display the complete tree, set P equal to 0.

所以你需要把P=0放在这个语法中：

dendrogram(tree,P,Name,Value)