ggplot2 热图，在图形之间具有固定比例的颜色条

Question

我需要绘制 3 个不同的图，设置相同的比例范围颜色。我有 3 个具有不同值范围的矩阵。

例如：

range(matrixA) 
# 0.60 0.85  
range(matrixB) 
# 0.65 0.95  
range(matrixA) 
# 0.5 1.0

我想为绘图填充相同的颜色。例如，对于差异图中的所有 0.8 值，如果在第一个图中 0.8 橙色，我希望不同图中的所有 0.8 值都是相同的橙色。

我现在的问题是：

在第一个图中，最大值的颜色是红色，那么值0.85就是红色。

在第二个图中，最大值为红色，但在本例中最大值为 0.95，问题就出现了。

我的代码：

mat.melted <- melt(matrixA)
colnames(mat.melted) <- c("p","c","v")
p <- ggplot(mat.melted, aes(x=c,y=p,fill=v) + 
         geom-tile() + 
         scale_fill_gradintn(limits = c(min(as.vector(matrixA)), max(as.vector(matrixA))), 
                             colors = c("yellow","orange","red"))

Answer 1

您需要为所有这些设置相同的范围（颜色条的限制）并指定颜色。

rng = range(matrixA, matrixB, matrixC)

并将此添加到您的 ggplot 代码中：

g + scale_fill_gradient2(low="green", mid="lightblue", high="red", #colors in the scale
               midpoint=mean(rng),    #same midpoint for plots (mean of the range)
               breaks=seq(0,1,0.25), #breaks in the scale bar
               limits=c(floor(rng[1]), ceiling(rng[2])))

示例：

下面是一个可以帮助您获得所需内容的示例：

x <- matrix(60:85, 5)/100
y <- matrix(65:95, 5)/100
z <- matrix(50:100, 5)/100


rng = range(c((x), (y), (z)))

library(reshape)
library(ggplot2)

ggplot(data = melt(x)) + geom_tile(aes(x=X1,y=X2,fill = value)) +
  scale_fill_gradient2(low="green", mid="lightblue", high="red", #colors in the scale
                   midpoint=mean(rng),    #same midpoint for plots (mean of the range)
                   breaks=seq(0,1,0.25), #breaks in the scale bar
                   limits=c(floor(rng[1]), ceiling(rng[2]))) + #same limits for plots
                   ggtitle("X")

ggplot(data = melt(y)) + geom_tile(aes(x=X1,y=X2,fill = value)) +
  scale_fill_gradient2(low="green", mid="lightblue", high="red", 
                   midpoint=mean(rng),   
                   breaks=seq(0,1,0.25), 
                   limits=c(floor(rng[1]), ceiling(rng[2]))) +
                    ggtitle("Y")                  
  
ggplot(data = melt(z)) + geom_tile(aes(x=X1,y=X2,fill = value)) +
 scale_fill_gradient2(low="green", mid="lightblue", high="red", 
                   midpoint=mean(rng),    
                   breaks=seq(0,1,0.25), 
                   limits=c(floor(rng[1]), ceiling(rng[2]))) +
                    ggtitle("Z")

这会给你：

ggplot2 热图，在图形之间具有固定比例的颜色条

ggplot2 heatmap with fixed scale colorbar between graphs

r

ggplot2

heatmap

color-palette