连接抖动点的线 - 多组躲避

Question

我尝试在 x 轴上连接来自两种不同方法 (measure) 的测量值之间的抖动点。先证者 (a) 将这些测量结果 link 相互 link，可以分为两大组，即患者 (pat) 和控件 (ctr), 我的df是这样的：

set.seed(1)
df <- data.frame(a = rep(paste0("id", "_", 1:20), each = 2),
                 value = sample(1:10, 40, rep = TRUE),
                 measure = rep(c("a", "b"), 20), group = rep(c("pat", "ctr"), each = 2,10))

我试过了

library(ggplot2)
ggplot(df,aes(measure, value, fill = group)) + 
  geom_point(position = position_jitterdodge(jitter.width = 0.1, jitter.height = 0.1,
                                             dodge.width = 0.75), shape = 1) +
  geom_line(aes(group = a), position = position_dodge(0.75))

^{由 reprex package (v0.3.0)}

于 2020 年 1 月 13 日创建

我使用了 fill 美学来将抖动的点与两组（pat 和 ctr）分开。我意识到，当我将 group = a 美学放入 ggplot 主调用时，它并没有很好地分离，但似乎 link 更好。

我的问题：有没有办法更好地将线连接到（抖动的）点，但保持两个主要组的分离，ctr 和 pat?

非常感谢。

Answer 1

您遇到的最大问题是您仅通过 group 躲避点，但也通过 a 躲避直线。

为了让你的线与轴保持原样，一种选择是手动躲避你的数据。这利用了引擎盖下的整数因素，将 group 的一级向右移动，另一级向左移动。

df = transform(df, dmeasure = ifelse(group == "ctr", 
                                     as.numeric(measure) - .25,
                                     as.numeric(measure) + .25 ) )

然后您可以使用 measure 作为 x 轴绘制，然后使用 "dodged" 变量作为 geom_point 和 geom_line 中的 x 轴变量。

ggplot(df, aes(x = measure, y = value) ) +
     geom_blank() +
     geom_point( aes(x = dmeasure), shape = 1 ) +
     geom_line( aes(group = a, x = dmeasure) )

如果您还想要抖动，也可以将其手动添加到 x 和 y 变量中。

df = transform(df, dmeasure = ifelse(group == "ctr", 
                                     jitter(as.numeric(measure) - .25, .1),
                                     jitter(as.numeric(measure) + .25, .1) ),
               jvalue = jitter(value, amount = .1) )

ggplot(df, aes(x = measure, y = jvalue) ) +
     geom_blank() +
     geom_point( aes(x = dmeasure), shape = 1 ) +
     geom_line( aes(group = a, x = dmeasure) )

连接抖动点的线 - 多组躲避

Lines connecting jittered points - dodging by multiple groups

r

ggplot2

jitter