使用 Eigen + Intel MKL + Pardiso

Question

我正在尝试使用 Eigen 对 MKL 和 Pardiso 的支持（参见下面的示例）。我已经使用 Intel link line advisor 来提供编译器选项，但我尝试的一切都不成功。特别是，编译：

$ icpc -I${HOME}/src/eigen -DEIGEN_USE_MKL_ALL -DMKL_ILP64 -I${MKLROOT}/include main.cpp -L${MKLROOT}/lib/intel64 -lmkl_intel_ilp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread -lm -ldl

导致以下类型错误：

~/src/eigen/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h(50): error: argument of type "int *" is incompatible with parameter of type "const long long *" ::pardiso(pt, &maxfct, &mnum, &type, &phase, &n, a, ia, ja, perm, &nrhs, iparm, &msglvl, b, x, &error);

在没有 64 位支持的情况下编译时，使用：

$ icpc -I${HOME}/src/eigen -DEIGEN_USE_MKL_ALL -I${MKLROOT}/include main.cpp -L${MKLROOT}/lib/intel64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread -lm -ldl

结果：

main.cpp:(.text+0x759): undefined reference to `pardiso'

我也试过用 OpenMP 编译，同样失败。

我应该如何编译？

（我使用的是 Intel 2016.3.210 和最新的 Eigen，3.3.3）

示例 (main.cpp)

本例求解泊松方程，具有两个狄利克雷边界条件 (u_{0} = u_{N+1} = 0)

#include <iostream>
#include <iomanip>
#include <math.h>
#include <Eigen/Dense>
#include <Eigen/PardisoSupport>

int main()
{
  typedef Eigen::SparseMatrix<double> SpMat;
  typedef Eigen::Triplet     <double> Trip;
  typedef Eigen::PardisoLU   <SpMat > Solver;

  size_t N = 11;

  SpMat A(N,N);
  Eigen::VectorXd f(N);

  f         *= 0.0;
  f((N-1)/2) = 1.0;

  std::vector<Trip> Atr;

  Atr.push_back(Trip(0,0,+2.0));
  Atr.push_back(Trip(0,1,-1.0));

  for ( size_t i=1; i<N-1; ++i ) {
    Atr.push_back(Trip(i,i-1,-1.0));
    Atr.push_back(Trip(i,i  ,+2.0));
    Atr.push_back(Trip(i,i+1,-1.0));
  }

  Atr.push_back(Trip(N-1,N-2,-1.0));
  Atr.push_back(Trip(N-1,N-1,+2.0));

  A.setFromTriplets(Atr.begin(),Atr.end());

  Solver solver;
  solver.analyzePattern(A);
  solver.factorize(A);

  Eigen::VectorXd u = solver.solve(f);

  return 0;
}

Answer 1

原来eigen3 documentation很清楚这一点：

Using Intel MKL through Eigen is easy:

...

on a 64bits system, you must use the LP64 interface (not the ILP64 one)

我现在已经成功编译

icpc -I${HOME}/src/eigen -DEIGEN_USE_MKL_ALL -DMKL_LP64 -I${MKLROOT}/include main.cpp -L${MKLROOT}/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread -lm -ldl

使用 Eigen + Intel MKL + Pardiso

Use Eigen + Intel MKL + Pardiso

c++

intel-mkl

eigen3

示例 (main.cpp)