使用 cp 保留父结构创建符号链接

Question

我有以下文件夹结构：

.
`-- top_level/
    |-- sub-01_ses-01/
    |   `-- filtered_data.tar.gz*
    |-- sub-01_ses-02/
    |   `-- filtered_data.tar.gz*
    |-- sub-02_ses-01/
    |   `-- filtered_data.tar.gz*
    |-- sub-02_ses-02/
    |   `-- filtered_data.tar.gz*

我想创建这些文件的符号链接以保留父结构（因为它们都具有相同的文件名）。 这是我尝试过的：

find -name "filtered_data.tar.gz" \
     -exec cp -s --parents --no-clobber -t /home/data/filtered {} \;

现在，我注意到 cp 确实创建了父结构，但是符号链接失败并且我收到以下通知：

cp: '/home/data/filtered/./sub-01_ses-01/filtered_data.tar.gz': can make relative symbolic links only in current directory

我想了解为什么会发生这种情况，以及 cp 警告试图告诉我什么。此外，将不胜感激有关如何解决该问题的任何指示。

Answer 1

在此处找到解决方案：symlink-copying a directory hierarchy

到 cp 的文件路径必须是绝对路径，而不是 ./something。所以，这应该适合你：

find $(pwd) -name "filtered_data.tar.gz" \
     -exec cp -s --parents --no-clobber -t /home/data/filtered {} \;

根据您对您真正想要做的事情的评论，这里有一个 Python 脚本可以做到这一点。你应该可以调整它。

#!/usr/bin/env python3

import os

target_filename = 'filtered_data.tar.gz'
top_src_dir = '.'
top_dest_dir = 'dest'

# Walk the source directory recursively looking for
# target_filename
for parent, dirs, files in os.walk(top_src_dir):
    # debugging
    # print(parent, dirs, files)

    # Skip this directory if target_filename not found
    if target_filename not in files:
        continue

    # Strip off all path parts except the immediate parent
    local_parent = os.path.split(parent)[-1]
    # Compute the full, relative path to the symlink
    dest_file = os.path.join(top_dest_dir, local_parent, target_filename)

    # debugging
    # print('{} {}'.format(dest_file, os.path.exists(dest_file)))

    # Nothing to do if it already exists
    if os.path.exists(dest_file):
        print('{} already exists'.format(dest_file))
        continue

    # Make sure the destination path exists
    dest_dir = os.path.dirname(dest_file)
    os.makedirs(dest_dir, exist_ok=True)

    # Translate the relative path to target_filename
    # to be relative based on the new destination dir
    src_file = os.path.join(parent, target_filename)
    src_file = os.path.relpath(src_file, start=dest_dir)

    os.symlink(src_file, dest_file)
    print('{} --> {}'.format(dest_file, src_file))

使用 cp 保留父结构创建符号链接

Create symbolic links with cp preserving parent structure

shell

cp