斐济 imagej 在 Ubuntu 16.04 崩溃

Question

我在我的 Ubuntu 16.04 机器上安装了 fiji（imagej 的一个发行版），双击桌面图标打开应用程序一秒钟，或者更确切地说，它试图打开，然后死了。我在网上找了一个答案，在这个页面 http://imagej.1557.x6.nabble.com/Fiji-crashes-UI-on-Ubuntu-all-recent-versions-td5005603.html 上找到了可以尝试

./ImageJ-linux64 --dry-run

这会打印出程序使用的运行命令。它调用系统java。所以我复制了命令，并切换到使用包含的 java（fiji 和 imagej 自带 java）并修复了它。我用命令创建了一个 shell 脚本（引用包含的 java 可执行文件），这个脚本可以启动 fiji。

Answer 1

转到您的斐济安装文件夹（Fiji.app 或任何名称）和运行

./ImageJ-linux64 --dry-run

这将输出一个长字符串，类似于

java -Dpython.cachedir.skip=true -Dplugins.dir=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app -Xmx3714m -Xincgc -XX:PermSize=128m -Djava.class.path=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app/jars/imagej-launcher-4.0.5.jar -Dimagej.dir=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app -Dij.dir=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app -Dfiji.dir=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app -Dfiji.defaultLibPath=lib/amd64/server/libjvm.so -Dfiji.executable=./ImageJ-linux64 -Dij.executable=./ImageJ-linux64 -Djava.library.path=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app/lib/linux64:/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app/mm/linux64 net.imagej.launcher.ClassLauncher -ijjarpath jars -ijjarpath plugins net.imagej.Main

将命令复制到脚本文件中，并将第一个 'java' 替换为包含的 java 可执行文件的完整路径，例如

/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app/java/linux-amd64/jdk1.8.0_66/jre/bin/java

将文件保存在目录（或任何你喜欢的地方）并调用它来启动斐济，类似于

./start_fiji.sh

斐济 imagej 在 Ubuntu 16.04 崩溃

fiji imagej crashes on Ubuntu 16.04

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