尽管不使用输出，但仍需要存储 Python 函数的输出

Question

我试图理解为什么我必须存储 Python 函数的输出（无论我使用的变量名称如何，也无论我随后是否使用该变量）。我认为这对 Python 来说更通用，而不是专门针对软件 NEURON，因此我把它放在 Whosebug 上。

兴趣线在这里：

clamp_output = attach_current_clamp(cell)

如果我只写 attach_current_clamp(cell)，而不将函数的输出存储到变量中，代码将不起作用（绘图为空），但我不使用 clamp_output全部。 为什么我不能直接调用函数？为什么我不用输出也必须用一个变量来存储输出？

import sys
import numpy
sys.path.append('/Applications/NEURON-7.4/nrn/lib/python')
from neuron import h, gui
from matplotlib import pyplot

#SET UP CELL
class SingleCell(object):
    def __init__(self):
        self.soma = h.Section(name='soma', cell=self)
        self.soma.L = self.soma.diam = 12.6517
        self.all = h.SectionList()
        self.all.wholetree(sec=self.soma)
        self.soma.insert('pas')
        self.soma.e_pas = -65

        for sec in self.all:
            sec.cm = 20
#CURRENT CLAMP
def attach_current_clamp(cell):
    stim = h.IClamp(cell.soma(1))
    stim.delay = 100
    stim.dur = 300
    stim.amp = 0.2
    return stim

cell = SingleCell()

#IF I CALL THIS FUNCTION WITHOUT STORING THE OUTPUT, THEN IT DOES NOT WORK
clamp_output = attach_current_clamp(cell)

#RECORD AND PLOT
soma_v_vec = h.Vector()
t_vec = h.Vector()
soma_v_vec.record(cell.soma(0.5)._ref_v)
t_vec.record(h._ref_t)
h.tstop = 800
h.run()
pyplot.figure(figsize=(8,4))
soma_plot = pyplot.plot(t_vec,soma_v_vec)
pyplot.show()

Answer 1

这是 NEURON+Python 特定的 bug/feature。它与 Python 垃圾收集和 NEURON 实现 Python-HOC 接口的方式有关。

当 Python 或 HOC 中不再引用 NEURON 对象（例如 IClamp）时，该对象将从 NEURON 中删除。

将 IClamp 保存为单元格的属性以与保存结果相同的方式避免问题，因此这可能是您的一个选择：

# In __init__:
self.IClamps = []

# In attach_current_clamp:
stim.amp = 0.2
cell.IClamps.append(stim)
#return stim

尽管不使用输出，但仍需要存储 Python 函数的输出

Storing output from Python function necessary despite not using output

python

object

neuron-simulator