R 中 coda 中 mcmc 函数的细化
Thinning for the mcmc function in coda in R
我对用于在给定数据的情况下声明 mcmc 对象的 coda 文档感到有点困惑。
它说（来自documentation on page 21）：
"Likewise, if data represents a chain that has already been thinned, the thinning interval should be given as the thin argument."
目前，我计划输入到该函数的数据集已经有样本因细化而被丢弃。换句话说，如果我原来的MCMC链是：0 1 2 3 4 5 6，我的细化间隔是2，那么我打算在coda中喂给mcmc函数的数据就是0,2,4,6。
这是文档中所说的已经 "thinned" 的链的意思吗？如果是这样，为什么我需要指定 thin = 2?
换句话说，我正在考虑是否应该这样调用函数，假设 data = c(0,2,4,6)：
mcmc（数据，薄 = 1）或 mcmc（数据，薄 = 2）？
谢谢！
它是 mcmc(data, thin = 2) 其中数据 = c(0,2,4,6).
如果您 plot(mcmc(data, thin = 2)) 和 plot(mcmc(data, thin = 1) 就会看到这个。在 thin = 1 的情况下，绘图将显示较少的迭代次数。
我对用于在给定数据的情况下声明 mcmc 对象的 coda 文档感到有点困惑。
它说（来自documentation on page 21）：
"Likewise, if data represents a chain that has already been thinned, the thinning interval should be given as the thin argument."
目前，我计划输入到该函数的数据集已经有样本因细化而被丢弃。换句话说，如果我原来的MCMC链是：0 1 2 3 4 5 6，我的细化间隔是2，那么我打算在coda中喂给mcmc函数的数据就是0,2,4,6。
这是文档中所说的已经 "thinned" 的链的意思吗？如果是这样，为什么我需要指定 thin = 2?
换句话说，我正在考虑是否应该这样调用函数，假设 data = c(0,2,4,6)： mcmc（数据，薄 = 1）或 mcmc（数据，薄 = 2）？
谢谢！
它是 mcmc(data, thin = 2) 其中数据 = c(0,2,4,6).
如果您 plot(mcmc(data, thin = 2)) 和 plot(mcmc(data, thin = 1) 就会看到这个。在 thin = 1 的情况下，绘图将显示较少的迭代次数。