将 ggplot2 geoms 添加到简单的特征图

Question

与 sp 相比，sf 包似乎是一种更加用户友好的处理空间数据的方法。比如我有一组latitude/longitude坐标，用开发版的ggplot2:

就可以很方便的画出来

library(sf)
devtools::install_github("tidyverse/ggplot2")
library(ggplot2)

# generate some data
set.seed(123)

y = rnorm(10, mean=40, sd=20)
x = rnorm(10, mean=-100, sd=30)

# collect to data.frame
xy = data.frame(x=x,y=y)

# create sf object
xy.sf = sf::st_as_sf(xy, coords=c("x", "y"), crs=4269)

# plot points
ggplot(data=xy.sf) + geom_sf()

ggplot2::geom_sf 函数知道 xy.sf 对象的几何形状是一组点，因此我不需要调用，例如 ggplot2::geom_point().

但是，假设我想根据点集添加另一个几何对象。

例如，如果我想生成一个轮廓层来显示点集中的位置，我会使用 ggplot2::geom_density2d 或 ggplot2::stat_density2d，如 this answer and this answer.[=24 中所建议的=]

但是下面的代码

ggplot(data=xy.sf) +
    geom_sf() +
    geom_density2d(data=xy.sf, aes(x=x,y=y,colour=..level..))

生成以下图像

请注意，轮廓线的坐标似乎颠倒了！

我尝试修改上面的代码，但无法正常工作。我意识到 sf 包相当新，但地图非常接近正确！有什么想法吗？

编辑: 忘记添加会话信息

> sessionInfo()
R version 3.4.0 (2017-04-21)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] ggplot2_2.2.1.9000 sf_0.4-3          

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.9       magrittr_1.5      maps_3.1.1        units_0.4-4      
 [5] MASS_7.3-47       munsell_0.4.3     geosphere_1.5-5   colorspace_1.3-2 
[9] lattice_0.20-35   rjson_0.2.15      jpeg_0.1-8        rlang_0.1.1      
[13] stringr_1.2.0     udunits2_0.13     plyr_1.8.4        tools_3.4.0      
[17] rgdal_1.2-5       grid_3.4.0        gtable_0.2.0      png_0.1-7        
[21] DBI_0.5-1         ggthemes_3.3.0    lazyeval_0.2.0    assertthat_0.1   
[25] digest_0.6.12     tibble_1.3.1      ggmap_2.6.1       reshape2_1.4.2   
[29] mapproj_1.2-4     labeling_0.3      sp_1.2-4          stringi_1.1.2    
[33] compiler_3.4.0    RgoogleMaps_1.4.1 scales_0.4.1      proto_1.0.0

Answer 1

为了将来参考，我想我 post 我的发现作为答案：

事实证明，在 geom_sf 之后添加一个图层，例如 geom_density2d，并不会继承应用于 geom_sf 的贴图美学。

请注意，这按预期工作：

ggplot(data=xy.sf, aes(x=x, y=y)) +
    geom_sf() +
    geom_density2d(aes(colour=..level..))

但这只是因为 x,y 作为对象存在 与 xy.sf 分开。

因此，以下会引发错误：

rm(x,y)
ggplot(data=xy.sf, aes(x=x, y=y)) +
    geom_sf() +
    geom_density2d(aes(colour=..level..))

Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'x' not found

当然可以在documentation!

中找到

"geom_sf uses a unique aesthetic: geometry ... Unlike other aesthetics, geometry will never be inherited from the plot."

所以我找到的解决方法是使用 x,y 对象本身，或者 sf 对象的纯 data.frame 版本；例如，geom_density2d(data=xy, aes(x,y,colour=..level..)).

将 ggplot2 geoms 添加到简单的特征图

Adding ggplot2 geoms to simple features plot

r

ggplot2

spatial

sf