获取FactoMineR包中提供的eta2table
Obtaining the eta2 table provided in the FactoMineR package
我正在使用 FactoMineR 在生物数据集上执行 PCA，其中每一列都是一个基因，而行包含不同的样本。样本属于不同的组 (control/treatment；cancer/noncancer)。在应用 PCA() 函数时，我将这些信息作为定性补充包括在内，我有点理解，当我们调用 $quali.sup$eta2 时，我们得到一个 table，每个分类之间的相关性平方变量和主成分。我的问题是：table 是如何精确计算出来的——相关性是如何精确计算出来的？
p41 上的包 vingette 将 eta2 标识为相关系数。
相关系数基于基础相关矩阵。
确切的方法应该在包作者提供的参考中。生成特征值和特征向量的方法通常是封装不同但矩阵代数大体相同
Husson, F., Le, S. and Pages, J. (2010). Exploratory Multivariate Analysis by Example Using R,
Chapman and Hall.
计算样本坐标（FactoMineR 术语中的个体）和分类变量 之间的相关性（平方），表示为数字因子水平 。
我正在使用 FactoMineR 在生物数据集上执行 PCA，其中每一列都是一个基因，而行包含不同的样本。样本属于不同的组 (control/treatment；cancer/noncancer)。在应用 PCA() 函数时，我将这些信息作为定性补充包括在内，我有点理解，当我们调用 $quali.sup$eta2 时，我们得到一个 table，每个分类之间的相关性平方变量和主成分。我的问题是：table 是如何精确计算出来的——相关性是如何精确计算出来的？
p41 上的包 vingette 将 eta2 标识为相关系数。
相关系数基于基础相关矩阵。
确切的方法应该在包作者提供的参考中。生成特征值和特征向量的方法通常是封装不同但矩阵代数大体相同
Husson, F., Le, S. and Pages, J. (2010). Exploratory Multivariate Analysis by Example Using R, Chapman and Hall.
计算样本坐标（FactoMineR 术语中的个体）和分类变量 之间的相关性（平方），表示为数字因子水平 。