Wavemulcor 包 - wave.multiple.cross.correlation 函数 - 替换长度为零

Question

我想使用 wavemulcor 包，尤其是 wave.multiple.cross.correlation 函数对我的数据执行小波多重互相关。

我正在按照包手册中的示例进行操作，但改用我的数据。该函数适用于示例数据，但当我尝试使用我的数据时会抛出错误。错误指的是 "replacement has length zero" 但我不确定这到底是什么意思。

我用谷歌搜索了这个错误，但有很多不同功能的相同问题的例子，通常它们都与代码中的循环有关。

然后我用谷歌搜索了如何解决问题并阅读了有关调试的信息。我尝试调试代码，但无法弄清楚它在哪里崩溃，我仍处于学习编码的早期阶段。我认为可能是 wave.multiple.cross.correlation 函数中的这段代码导致了问题：

xy.cor.vec <- matrix(unlist(xy.cor), l, dd)
    xy.mulcor <- matrix(0, l, 2 * lm + 1)
    YmaxR <- vector("numeric", l)
    for (i in 1:l) {
        r <- xy.cor.vec[i, ]
        P <- diag(d)/2
        P[lower.tri(P)] <- r
        P <- P + t(P)
        Pidiag <- diag(solve(P))
        if (is.null(ymaxr)) {
            YmaxR[i] <- Pimax <- which.max(Pidiag)
        }

有没有其他方法可以确定为什么这不起作用？

实际错误如下：

> Lst <- wave.multiple.cross.correlation(xx, lag.max = NULL, ymaxr = NULL)
Error in YmaxR[i] <- Pimax <- which.max(Pidiag) : 
  replacement has length zero

我试图追踪原始代码中的所有变量，但我就是想不通。

这是我尝试使用的代码，为了完整起见，here 是一个 link 到 xx 的 dput()，它是我希望使用的变量列表，请参阅xx

详情请见下方代码

library(wavemulcor)
library(readxl)

rm(list = ls()) # clear objects
graphics.off() # close graphics windows

RNC20_30Hourly <- read_excel(RNC20_30Hourly.xlsx")

RNC20_30Hourly <- RNC20_30Hourly[-1]

RNC20_30TS <- ts(RNC20_30Hourly, start = 1, frequency = 23)

wf <- "d4"
J <- 6
lmax <- 36

n <- nrow(RNC20_30TS)

CK0158U09A3.modwt <- modwt(RNC20_30TS[,"CK0158U09A3"], wf, J)
CK0158U09A3.modwt.bw <- brick.wall(CK0158U09A3.modwt, wf)

CK0158U21A1.modwt <- modwt(RNC20_30TS[,"CK0158U21A1"], wf, J)
CK0158U21A1.modwt.bw <- brick.wall(CK0158U21A1.modwt, wf)

CK0158U21A2.modwt <- modwt(RNC20_30TS[,"CK0158U21A2"], wf, J)
CK0158U21A2.modwt.bw <- brick.wall(CK0158U21A2.modwt, wf)

CK0158U21A3.modwt <- modwt(RNC20_30TS[,"CK0158U21A3"], wf, J)
CK0158U21A3.modwt.bw <- brick.wall(CK0158U21A3.modwt, wf)

xx <- list(CK0158U09A3.modwt.bw, 
           CK0158U21A1.modwt.bw, 
           CK0158U21A2.modwt.bw,
           CK0158U21A3.modwt.bw)

Lst <- wave.multiple.cross.correlation(xx, lag.max = 13, ymaxr = NULL)

CK0158.RTWP.cross.cor <- as.matrix(Lst$xy.mulcor[1:J,])
YmaxR <- Lst$YmaxR

cell.names <- c("CK0158U09A3", "CK0158U21A1", "CK0158U21A2", "CK0158U21A3")
rownames(CK0158.RTWP.cross.cor)<-rownames(CK0158.RTWP.cross.cor,
                                          do.NULL = FALSE, prefix = "Level ")
lags <- length(-lmax:lmax)

lower.ci <- tanh(atanh(CK0158.RTWP.cross.cor) - qnorm(0.975) /
                   sqrt(matrix(trunc(n/2^(1:J)), nrow=J, ncol=lags)- 3))
upper.ci <- tanh(atanh(CK0158.RTWP.cross.cor) + qnorm(0.975) /
                   sqrt(matrix(trunc(n/2^(1:J)), nrow=J, ncol=lags)- 3))

par(mfrow=c(3,2), las=1, pty="m", mar=c(2,3,1,0)+.1, oma=c(1.2,1.2,0,0))
for(i in J:1) {
  matplot((1:(2*lmax+1)),CK0158.RTWP.cross.cor[i,], type="l", lty=1, ylim=c(-1,1),
          xaxt="n", xlab="", ylab="", main=rownames(CK0158.RTWP.cross.cor)[[i]][1])
  if(i<3) {axis(side=1, at=seq(1, 2*lmax+1, by=12),
                labels=seq(-lmax, lmax, by=12))}
  #axis(side=2, at=c(-.2, 0, .5, 1))
  lines(lower.ci[i,], lty=1, col=2) ##Add Connected Line Segments to a Plot
  lines(upper.ci[i,], lty=1, col=2)
  abline(h=0,v=lmax+1) ##Add Straight horiz and vert Lines to a Plot
  text(1,1, labels=cell.names[YmaxR[i]], adj=0.25, cex=.8)
}
par(las=0)
mtext('Lag (hours)', side=1, outer=TRUE, adj=0.5)
mtext('Wavelet Multiple Cross-Correlation', side=2, outer=TRUE, adj=0.5)

任何对 resolve/troubleshoot 这个问题的帮助将不胜感激。

Answer 1

仔细检查代码后，我发现了代码中的错误。根据手册，用法如下：

wave.multiple.cross.correlation(xx, lag.max = NULL, ymaxr = NULL)

但在提供的示例中，作者使用了一个名为 lmax 的不同变量，它指定要使用的滞后。

Lst <- wave.multiple.cross.correlation(xx, lmax)

从我上面的示例中可以看出，我为滞后指定了两个不同的参数，lmax = 36 和 lag.max = 13

啊好吧，我只花了 100 个声望！

Answer 2

看来，鉴于您的时间序列的长度，您将最大小波级别 J 设置得太高（代码的第 14 行）：

14 焦 <- 6

试试 J <- 4 和运行

Lst <- wave.multiple.cross.correlation.prueba(xx, lag.max = lmax, ymaxr = NULL)

其中 lmax 是您之前设置为 36（或您选择的任何其他合理值）的最大延迟。

一般来说，最大小波水平的推荐值为J = t运行c(log2(T))-3（为了安全起见），其中T = 时间序列的长度.

事实上，报告的错误是您的原始 xx 列表的结果，其中级别 d6 和 s6 填充了 NaN。请注意，这不是 wavemulcor 包的一部分，而是小波变换先前计算的一部分在输入您选择的 wavemulcor 包函数之前。

希望对您有所帮助。

Wavemulcor 包 - wave.multiple.cross.correlation 函数 - 替换长度为零

Wavemulcor package - wave.multiple.cross.correlation function - replacement has length zero

r

time-series

cross-correlation

wavelet-transform