data.table R 中的 strsplit 函数

Question

我有一个 table，其中我的一个专栏 (mydata$Gene) 有一些 ID，格式如下：

ENSG00000000419.8
ENSG00000000460.12

我想了解如何使用 strsplit 函数删除 .xx 部分

所以我希望所有输出都显示为

ENSG00000000419
ENSG00000000460

等等

到目前为止我尝试了以下代码：

strsplit(mydata$Gene, ".", fixed=TRUE)

但出现错误：

Error in strsplit(mydata$Gene, ".", fixed = TRUE) : non-character argument

还有

strsplit(mydata$Gene, "\.", fixed=TRUE)

Error: '.' is an unrecognized escape in character string starting ""."

有什么建议吗？

感谢您的宝贵时间。

Answer 1

这行得通，因为您的数据看起来像是一个因素：

> strsplit(as.character(mydata$Gene), ".", fixed=TRUE)
[[1]]
[1] "ENSG00000000419" "8"              

[[2]]
[1] "ENSG00000000460" "12"

但是如果您只需要点之前的文字，您可以通过替换替换来做得更好：

> sub("\..*$","",mydata$Gene)
[1] "ENSG00000000419" "ENSG00000000460"
>

strsplit function in R for data.table