未使用的参数 - corrplot？

Question

我是新手。我想使用 corrplot 创建一个相关矩阵并使用以下代码：

 cor.mtest <- function(mat, ...) {
    mat <- as.matrix(mat)
    n <- ncol(mat)
    p.mat<- matrix(NA, n, n)
    diag(p.mat) <- 0
    for (i in 1:(n - 1)) {
        for (j in (i + 1):n) {
            tmp <- cor.test(mat[, i], mat[, j], ...)
            p.mat[i, j] <- p.mat[j, i] <- tmp$p.value
        }
    }
  colnames(p.mat) <- rownames(p.mat) <- colnames(mat)
  p.mat
}

        p.mat<-cor.mtest(dataset)

    corrplot(cor(dataset, use="complete.obs"), type="upper", order="hclust", 

    p.mat=p.mat, sig.level=0.1)

这是我以前用过的，但这次我收到一条错误消息：

Error in corrplot(cor(dataset, use = "complete.obs"), type = "upper",  : 
  unused arguments (type = "upper", order = "hclust", p.mat = p.mat, sig.level = 0.01)

知道这是为什么吗？我该如何解决？

Answer 1

R 中的 unused argument 错误意味着您提供的命名参数与函数的实际参数不匹配。这通常是由于拼写错误或意外使用来自不同包的类似名称的函数引起的。

看起来在这种情况下被标记的参数是针对 corrplot 包的 corrplot 函数的。其他包中还有其他 corrplot 函数，例如arm。你确定你加载了正确的包吗？

Answer 2

library(corrplot)

dat = read.csv('yourdata')

M<- cor(t(dat[,-1]), use="complete.obs", method="pearson")
corr <- round(cor(M),1)

corrplot(corr , method = "color",is.corr = FALSE
         ,order = "hclust",hclust.method = c("complete"))

未使用的参数 - corrplot？

Unused argument - corrplot?

r

r-corrplot