dplyr::summarize_at – 按传递的变量顺序对列进行排序，然后按应用函数的顺序对列进行排序

Question

问题

通过使用 dplyr::summarize_at()（或等价物），我想获得 table 摘要，其中列首先按 (G) 排序使用的分组变量顺序，然后按 (V) 传递变量的顺序，最后按 (F) 应用函数的顺序。默认顺序是先G，再F，最后V。

例子

代码：

library(purrr)
library(dplyr)

q025 <- partial(quantile, probs  = 0.025, na.rm = TRUE)
q975 <- partial(quantile, probs  = 0.975, na.rm = TRUE)

vars_to_summarize <- c("height", "mass")

my_summary <- starwars %>% 
    filter(skin_color  %in% c("gold", "green")) %>% 
    group_by(skin_color) %>% 
    summarise_at(vars_to_summarize, funs(q025, mean, q975))

结果：

my_summary
## A tibble: 2 x 7
##   skin_color height_q025 mass_q025 height_mean mass_mean height_q975 mass_q975
##        <chr>       <dbl>     <dbl>       <dbl>     <dbl>       <dbl>     <dbl>
## 1       gold     167.000      75.0         167        75      167.00      75.0
## 2      green      79.375      22.7         169        NA      204.75     110.4

所需的变量顺序应为：

skin_color, height_q025, height_mean, height_q975, mass_q025, mass_mean, mass_q975

我想使用类似这样（天真简单）的代码：

my_summary  %>% 
    select(everything(), starts_with(vars_to_summarize))

但是不行。即使这段代码也不能像我预期的那样工作（尽管这不是我寻求的通用解决方案）：

my_summary  %>% 
    select(everything(),
           starts_with(vars_to_summarize[1]),
           starts_with(vars_to_summarize[2]))

很可能 everything() 应该始终是 select() 中的最后一个参数。

概括

说，我有：

N 我传递给 group_by(),
L 需要汇总的变量（"var_"）和
M 要应用的摘要函数（“fun_”）。

一般来说，变量的期望顺序在摘要中 table 应遵循以下模式：

gr_1, gr_2, ..., gr_N,   
var_1_fun_1, var_1_fun_2, ..., var_1_fun_M,  
var_2_fun_1, var_2_fun_2, ..., var_2_fun_M, 
...,
var_L_fun_1, var_L_fun_2, ..., var_L_fun_M

Answer 1

我们可以使用matches和grep

my_summary %>%
    select(grep(paste(vars_to_summarize, collapse="|"), names(.), invert = TRUE), 
           matches(vars_to_summarize[1]),
           matches(vars_to_summarize[2]))
# A tibble: 2 x 7
#    skin_color height_q025 height_mean height_q975 mass_q025 mass_mean mass_q975
#       <chr>       <dbl>       <dbl>       <dbl>     <dbl>     <dbl>     <dbl>
#1       gold     167.000         167      167.00      75.0        75      75.0
#2      green      79.375         169      204.75      22.7        NA     110.4

如果有很多列，那么另一种选择是从列名称中的 _ 中删除子字符串，match 中的 'vars_to_summarize' 和 order select

my_summary %>% 
   select(order(match(sub("_.*", "", names(.)), vars_to_summarize, nomatch = 0)))
# A tibble: 2 x 7
#    skin_color height_q025 height_mean height_q975 mass_q025 mass_mean mass_q975
#       <chr>       <dbl>       <dbl>       <dbl>     <dbl>     <dbl>     <dbl>
#1       gold     167.000         167      167.00      75.0        75      75.0
#2      green      79.375         169      204.75      22.7        NA     110.4

dplyr::summarize_at – 按传递的变量顺序对列进行排序，然后按应用函数的顺序对列进行排序

dplyr::summarize_at – sort columns by order of variables passed, then by order of functions applied

r

sorting

dplyr

summarize