如何使用 Box cox 传输数据?
How can transfer data using Box cox?
我有如下数据。
数据:
temperature stage Replicate week Nematode_Number
T20 All 1 1 60.0
T20 All 2 1 72.7
T20 All 3 1 69.3
T20 All 4 1 45.3
T20 All 5 1 40.7
我喜欢找线性模型,然后对这个数据基于Box cox归一化数据,但是有一个错误。
Script:
> mode (all)
[1] "list"
> is.data.frame (all)
[1] TRUE
> getClass(class(all))
Class "data.frame" [package "methods"]
Slots:
Name: .Data names row.names .S3Class
Class: list character data.frameRowLabels character
Extends:
Class "list", from data part
Class "oldClass", directly
Class "vector", by class "list", distance 2
> a <- boxcox(lm(Nematode_Number ~ week, data = all))
Error in terms.formula(formula, data = data) : 'data' argument is of the wrong type
boxcox
应该可以。那么 boxcox 也确实采用公式对象。因此,如果可以,请尝试清理您的环境或 rm(all)
并重新阅读。然后尝试下面的代码,如果此代码在上述之前不起作用。
a=boxcox(Nematode_Number~week,data=all)
希望对您有所帮助
数据
df <- data.frame(temperature=rep("T20",5),
stage=rep("All",5),
Replicate=1:5, week=rep(1,5),
Nematode_Number=c(60.0, 72.7, 69.3, 45.3, 40.7),
stringsAsFactors=F)
这是你想要的吗?
这个有效
lm(Nematode_Number ~ week, data=df)
这行得通
library(MASS)
boxcox(Nematode_Number ~ week, data=df)
这行得通
temp <- lm(Nematode_Number ~ week, data=df)
boxcox(temp, data=df)
我有如下数据。
数据:
temperature stage Replicate week Nematode_Number
T20 All 1 1 60.0
T20 All 2 1 72.7
T20 All 3 1 69.3
T20 All 4 1 45.3
T20 All 5 1 40.7
我喜欢找线性模型,然后对这个数据基于Box cox归一化数据,但是有一个错误。
Script:
> mode (all)
[1] "list"
> is.data.frame (all)
[1] TRUE
> getClass(class(all))
Class "data.frame" [package "methods"]
Slots:
Name: .Data names row.names .S3Class
Class: list character data.frameRowLabels character
Extends:
Class "list", from data part
Class "oldClass", directly
Class "vector", by class "list", distance 2
> a <- boxcox(lm(Nematode_Number ~ week, data = all))
Error in terms.formula(formula, data = data) : 'data' argument is of the wrong type
boxcox
应该可以。那么 boxcox 也确实采用公式对象。因此,如果可以,请尝试清理您的环境或 rm(all)
并重新阅读。然后尝试下面的代码,如果此代码在上述之前不起作用。
a=boxcox(Nematode_Number~week,data=all)
希望对您有所帮助
数据
df <- data.frame(temperature=rep("T20",5),
stage=rep("All",5),
Replicate=1:5, week=rep(1,5),
Nematode_Number=c(60.0, 72.7, 69.3, 45.3, 40.7),
stringsAsFactors=F)
这是你想要的吗?
这个有效
lm(Nematode_Number ~ week, data=df)
这行得通
library(MASS)
boxcox(Nematode_Number ~ week, data=df)
这行得通
temp <- lm(Nematode_Number ~ week, data=df)
boxcox(temp, data=df)