在 ggplot 中包含极端异常值的指示

Question

我的数据集中有一些非常非常少的异常值，使得箱线图难以阅读：

library(ggplot2)
mtcars$mpg[1] <- 60
p <- ggplot(mtcars, aes(factor(cyl), mpg))
p + geom_boxplot()

因此，我想指出这样的极端异常值：

知道如何在 ggplot2 中执行此操作吗？转换轴对我来说不是一个选项...

Answer 1

这是一个开始：

library("ggplot2")
mtcars$mpg[1:2] <- c(50,60)
p <- ggplot(mtcars, aes(factor(cyl), mpg))
p + geom_boxplot()

定义最大值：

maxval <- 40

使用dplyr（也可以在 base R 或 plyr 中完成）提取异常值并将文本字符串放在一起：

library("dplyr")
dd <- mtcars %>% filter(mpg>maxval) %>%
    group_by(cyl) %>%
        summarise(outlier_txt=paste(mpg,collapse=","))

设置最大 y 值并添加箭头加标签：

library("grid") # needed for arrow() function
p2 <- p + geom_boxplot() +
    scale_y_continuous(limits=c(min(mtcars$mpg),maxval))+
       geom_text(data=dd,aes(y=maxval,label=outlier_txt),
                 size=3,vjust=1.5,hjust=-0.5)+
          geom_segment(data=dd,aes(y=maxval*0.95,yend=maxval,
                       xend=factor(cyl)),
                 arrow = arrow(length = unit(0.1,"cm")))
p2

在 ggplot 中包含极端异常值的指示

Include indication of extreme outliers in ggplot

r

outliers

ggplot2