sklearn中StratifiedKFold和StratifiedShuffleSplit的区别

Question

从标题看，我想知道

有什么区别

StratifiedKFold 带参数 shuffle = True

StratifiedKFold(n_splits=10, shuffle=True, random_state=0)

和

StratifiedShuffleSplit

StratifiedShuffleSplit(n_splits=10, test_size=’default’, train_size=None, random_state=0)

以及使用 StratifiedShuffleSplit 的优势是什么

Answer 1

在 KFolds 中，每个测试集不应重叠，即使是随机播放。使用 KFolds 和 shuffle，数据在开始时被打乱一次，然后分成所需的拆分数。测试数据始终是拆分之一，训练数据是其余部分。

在ShuffleSplit中，每次都会对数据进行shuffle，然后进行split。这意味着测试集可能会在拆分之间重叠。

有关差异的示例，请参见此块。注意 ShuffleSplit 测试集中元素的重叠。

splits = 5

tx = range(10)
ty = [0] * 5 + [1] * 5

from sklearn.model_selection import StratifiedShuffleSplit, StratifiedKFold
from sklearn import datasets

kfold = StratifiedKFold(n_splits=splits, shuffle=True, random_state=42)
shufflesplit = StratifiedShuffleSplit(n_splits=splits, random_state=42, test_size=2)

print("KFold")
for train_index, test_index in kfold.split(tx, ty):
    print("TRAIN:", train_index, "TEST:", test_index)

print("Shuffle Split")
for train_index, test_index in shufflesplit.split(tx, ty):
    print("TRAIN:", train_index, "TEST:", test_index)

输出：

KFold
TRAIN: [0 2 3 4 5 6 7 9] TEST: [1 8]
TRAIN: [0 1 2 3 5 7 8 9] TEST: [4 6]
TRAIN: [0 1 3 4 5 6 8 9] TEST: [2 7]
TRAIN: [1 2 3 4 6 7 8 9] TEST: [0 5]
TRAIN: [0 1 2 4 5 6 7 8] TEST: [3 9]
Shuffle Split
TRAIN: [8 4 1 0 6 5 7 2] TEST: [3 9]
TRAIN: [7 0 3 9 4 5 1 6] TEST: [8 2]
TRAIN: [1 2 5 6 4 8 9 0] TEST: [3 7]
TRAIN: [4 6 7 8 3 5 1 2] TEST: [9 0]
TRAIN: [7 2 6 5 4 3 0 9] TEST: [1 8]

至于何时使用它们，我倾向于使用 KFolds 进行任何交叉验证，并且我将 ShuffleSplit 的拆分为 2 用于我的 train/test 集拆分。但我确信两者还有其他用例。

Answer 2

@Ken Syme 已经有了很好的答案。我只是想补充一点。

StratifiedKFold 是 KFold 的变体。首先，StratifiedKFold 打乱您的数据，然后将数据拆分为 n_splits 部分并完成。现在，它将使用每个部分作为测试集。请注意，它只会并且总是在拆分之前将数据洗牌一次。

使用 shuffle = True，数据由您的 random_state 打乱。除此以外，数据按 np.random 打乱（默认）。例如，对于 n_splits = 4，您的数据对于 y（因变量）有 3 个 classes（标签）。 4个测试集覆盖所有数据，没有任何重叠。

另一方面，StratifiedShuffleSplit 是 ShuffleSplit 的变体。首先，StratifiedShuffleSplit 打乱您的数据，然后还将数据拆分为 n_splits 部分。然而，这还没有完成。在这一步之后，StratifiedShuffleSplit 选择一个部分作为测试集。然后它重复相同的过程 n_splits - 1 次，以获得 n_splits - 1 其他测试集。看下图，同样的数据，但是这次4个测试集没有覆盖所有的数据，即测试集之间有重叠。

因此，这里的区别在于StratifiedKFold 只是洗牌和拆分一次，因此测试集不重叠，而StratifiedShuffleSplit 每次拆分前shuffle，拆分n_splits次，测试集重叠。

注意：这两种方法都使用了"stratified fold"（这就是为什么"stratified"出现在两个名称中的原因）。这意味着每个部分保留与原始数据相同百分比的每个 class（标签）样本。您可以在 cross_validation documents

Answer 3

KFold、StratifiedKFold、StratifiedShuffleSplit的输出示例：

以上图形输出是@Ken Syme代码的扩展：

from sklearn.model_selection import KFold, StratifiedKFold, StratifiedShuffleSplit
SEED = 43
SPLIT = 3

X_train = [0,1,2,3,4,5,6,7,8]
y_train = [0,0,0,0,0,0,1,1,1]   # note 6,7,8 are labelled class '1'

print("KFold, shuffle=False (default)")
kf = KFold(n_splits=SPLIT, random_state=SEED)
for train_index, test_index in kf.split(X_train, y_train):
    print("TRAIN:", train_index, "TEST:", test_index)

print("KFold, shuffle=True")
kf = KFold(n_splits=SPLIT, shuffle=True, random_state=SEED)
for train_index, test_index in kf.split(X_train, y_train):
    print("TRAIN:", train_index, "TEST:", test_index)

print("\nStratifiedKFold, shuffle=False (default)")
skf = StratifiedKFold(n_splits=SPLIT, random_state=SEED)
for train_index, test_index in skf.split(X_train, y_train):
    print("TRAIN:", train_index, "TEST:", test_index)
    
print("StratifiedKFold, shuffle=True")
skf = StratifiedKFold(n_splits=SPLIT, shuffle=True, random_state=SEED)
for train_index, test_index in skf.split(X_train, y_train):
    print("TRAIN:", train_index, "TEST:", test_index)
    
print("\nStratifiedShuffleSplit")
sss = StratifiedShuffleSplit(n_splits=SPLIT, random_state=SEED, test_size=3)
for train_index, test_index in sss.split(X_train, y_train):
    print("TRAIN:", train_index, "TEST:", test_index)

print("\nStratifiedShuffleSplit (can customise test_size)")
sss = StratifiedShuffleSplit(n_splits=SPLIT, random_state=SEED, test_size=2)
for train_index, test_index in sss.split(X_train, y_train):
    print("TRAIN:", train_index, "TEST:", test_index)

sklearn中StratifiedKFold和StratifiedShuffleSplit的区别

difference between StratifiedKFold and StratifiedShuffleSplit in sklearn

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