将交互式闪亮应用程序合并到 Rmarkdown 文档中,用于 blogdown Hugo 博客

Incorporating interactive shiny apps into Rmarkdown document for blogdown Hugo blog

我正在尝试使用 RMarkdown 将我的第一个 post 上传到 Hugo 博客。您可以在下面找到我创建文档的代码:

---
title: "Untitled"
author: "Jorge"
date: "September 9, 2017"
output: html_document
runtime: shiny
---


```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)

```


```{r echo=FALSE, include=FALSE}
data('USArrests')
head(USArrests)
```
```{r echo = TRUE, include = FALSE}

library(tidyverse)
library(maps)
library(mapproj)
library(geosphere)
library(ggrepel)
library(scales)
library(RColorBrewer)
library(plotly)
library(shiny)
```

## Map
```{r, echo = FALSE, include = TRUE}

us_states <- map_data('state')
USArrests$region <- tolower(row.names(USArrests))
arrest_map_data <- merge(us_states, USArrests, by = 'region')
arrest_map_data <- arrest_map_data[order(arrest_map_data$order),]

inputPanel(
  selectInput("crime", label = "Crime: ",
          choices = list('Murder' = 'Murder', 
                         'Assault' = 'Assault', 
                         'Rape' = 'Rape'), selected = 'Murder')

)

renderPlot(

  ggplot() + coord_map() + 
geom_map(data = arrest_map_data, map = arrest_map_data,
                              aes(x = long, y = lat, map_id = region),
                              fill = "grey80", color = "black", size = 0.15) +
                     geom_polygon(data = arrest_map_data, aes_string(x = 'long', y = 'lat', 
                                                            group = 'group', fill = input$crime)) +
                     scale_fill_gradient(low = 'light blue', high = 'dark blue', name = 'Arrests per 100,000\nresidents') +
                     theme(legend.position = 'bottom', 
                           panel.grid = element_blank(),
                           panel.background = element_blank(),
                           axis.text = element_blank(),
                           axis.title = element_blank())
)
```

## Scatterplot
```{r, echo = FALSE, include = TRUE}

inputPanel(

  checkboxGroupInput("crime2", label = "Crime: ",
              choices = list('Murder' = 'Murder', 
                         'Assault' = 'Assault', 
                         'Rape' = 'Rape'), selected = c('Murder', 'Assault'))
)

renderPlotly(

  ggplotly(ggplot(data = USArrests, 
              aes_string(x = input$crime2[1], y = input$crime2[2], text = input$region)) + 
      geom_point(fill = "grey80", color = "black", size = (USArrests$UrbanPop) / 10))
)
```

我将其保存为 .Rmd 文件,位于与 blogdown 目录相关的 R 项目的“帖子”部分。当我 运行:

blogdown::serve_site()

我收到一条错误消息: 错误:未提供 html_dependency 的路径 执行暂停 render_page(f) 中的错误: 如上所示的页面。

我是 blogdown 的新手,找不到解决此错误的方法,所以如果有人可以提供一些关于如何解决此错误并将交互式闪亮应用程序包含到 Hugo 中的见解,请告诉我。

谢谢!

blogdown 包用于静态网站,这意味着您只能生成静态页面。闪亮的应用程序依赖于实时 R 会话,因此除非您使用 iframe,否则它们不能嵌入静态 HTML 页面。也就是说,您不能将 Shiny R Markdown 文档 (runtime: shiny) 与 blogdown 一起使用。您必须在 R 和 Shiny Server 可用的服务器上发布 Shiny 应用程序,并使用 <iframe src="URL-OF-YOUR-SHINY-APP"></iframe> 将应用程序嵌入网页。