如何使用 gml 格式文件将 igraph 边缘属性设置为字符串？

Question

我使用 GML 图形文件格式将图形读入 igraph（R 版本）。有没有办法将边缘属性设置为字符串？似乎允许某些属性标签具有字符串值，而其他属性标签则不允许。示例输入文件：

graph [
node [
    id 1
    control 1
    label "CiscoSW-1"
]
node [
    id 2
    control 1
    label "CiscoSW-z"
]
edge [
    source 1
    target 2
    difficulty 'A,B,C'
    label "CiscoSW-1"
]
]

Answer 1

似乎 read_graph 不喜欢单引号 ' '，因此您需要将它们换成双引号 " "。

一种方法是读入文件，gsub找出有问题的引用，然后用 read_graph 再次读入。所以如果你的图形文件保存为so.gml，那么

# Read in file, `gsub` quotes and write to tempfile()
r <- gsub("[']", "\"", readLines("so.gml"))
cat(r, file=temp<-tempfile())

# Read amended gml file 
g <- read_graph(temp, format="gml")

检查边缘属性是否符合预期

edge.attributes(g)

如何使用 gml 格式文件将 igraph 边缘属性设置为字符串？

How to set igraph edge attributes to strings using a gml format file?

r

igraph