Bash 脚本：目录中的所有文件

Question

我是一名编码新手，在编写 bash 脚本时遇到了问题，在该脚本中，我的目录（number001.log、number002.log 等）中的所有日志文件都通过以下方式进行处理一个 perl 脚本 (map_shifts2PDB.pl) 和每个 numberXXX.log 文件的结果连接到一个 results.out 文件。 perl 脚本需要以下参数 ./map_shifts2PDB.pl <path of logfile> <path of test.pdb> (constant) 和要处理的日志文件的编号。我不知道如何将它同步到循环中正在读取的日志文件。这是我目前所拥有的：

#!/bin/bash

for f in ~/TrpCage_1L2Y/1L2Y_min_explicit/model1_charged/calculate/*.log; do

./map_shifts2PDB.pl ~/TrpCage_1L2Y/1L2Y_min_explicit/model1_charged/calculate ~/TrpCage_1L2Y/1L2Y
_min_explicit/model1_charged/test.pdb 1 >> results.out

done

Answer 1

只需使用参数扩展从文件名中提取数字：

num=${f##*/number}    # Delete everything up to /number.
num=${num%.log}       # Delete the extension.
./map_shifts2PDB.pl \ 
    ~/TrpCage_1L2Y/1L2Y_min_explicit/model1_charged/calculate \
    ~/TrpCage_1L2Y/1L2Y_min_explicit/model1_charged/test.pdb \
    $num >> results.out

标题中的"recursive"是什么意思？

Bash 脚本：目录中的所有文件

Bash Script: All files in directory

bash

recursion

concatenation