在没有范围技巧的情况下将额外参数传递给 GenericUnivariateSelect

Question

编辑：

如果我应用答案中建议的 make_scorer 解决方法，这里是完整的回溯...

`File "________python/anaconda-2.7.11-64/lib/python2.7/site-packages/spyder/utils/site/sitecustomize.py", line 880, in runfile
    execfile(filename, namespace)

  File ""________python/anaconda-2.7.11-64/lib/python2.7/site-packages/spyder/utils/site/sitecustomize.py", line 94, in execfile
    builtins.execfile(filename, *where)

  File ""________/main_"________.py", line 43, in <module>
    "_________index.fit(X,Y ,g=g,L=L)

  File ""________/Core.py", line 95, in fit
    X_preprocessed=self.preprocessing.fit_transform(X,y)

  File ""________python/anaconda-2.7.11-64/lib/python2.7/site-packages/sklearn/pipeline.py", line 303, in fit_transform
    return last_step.fit_transform(Xt, y, **fit_params)

  File ""________/python/anaconda-2.7.11-64/lib/python2.7/site-packages/sklearn/base.py", line 497, in fit_transform
    return self.fit(X, y, **fit_params).transform(X)

  File "Base/Base.py", "________
    score_func_ret = self.score_func(X, y)

TypeError: __call__() takes at least 4 arguments (3 given)`

我正在研究 sklearn 管道。

custom_filter=GenericUnivariateSelect(Custom_Score,mode='MinScore',param=0.9)   
custom_filter._selection_modes.update({'MinScore': SelectMinScore})
MyProcessingPipeline=Pipeline(steps=[...
                           ('filter_step', None),
                           ....])
ProcessingParams.update({'filter_step':custom_filter})
MyProcessingPipeline.set_params(**ProcessingParams)

其中 SelectMinScore 是自定义 BaseFilter。

我需要根据 Custom_Score 执行单变量特征选择，必须接收一个额外的参数，在此处称为 XX

def Custom_Score(X,Y,XX=_XX ):
      # do stuff
      return my_score

不幸的是，AFAIK sklearn API 不允许将额外的参数传递给管道步骤的参数的参数。

我试过了

MyProcessingPipeline({'filter_step':custom_filter(XX=_XX)})

但这打破了参数传递级联（我相信）。

到目前为止，我已经通过编写包装器解决了这个问题，其中 _XX 是我需要的数据，不幸的是，它在定义时需要在函数的范围内。所以我最终在我的 main 函数中定义了函数，以便 _XX 存在并且可以传递。

def Custom_Score_Wrapped(X,Y):
            return Custom_Score(X,Y,XX=_XX )

我认为这是一个非常肮脏的解决方法。

正确的做法是什么？

Answer 1

您可以在调用 make_scorer() 函数时简单地传递额外的参数。比如你check this link。在示例中，它使用了 fbeta_score。现在 fbeta 需要一个额外的参数，beta，它是在调用 make_scorer() 函数时设置的，如下所示：

ftwo_scorer = make_scorer(fbeta_score, beta=2)

所以在你的情况下，这应该有效：

def Custom_Score(X,Y,XX):
  # do stuff
  return my_score

my_scorer = make_scorer(Custom_Score,XX=_XX)

在没有范围技巧的情况下将额外参数传递给 GenericUnivariateSelect

passing an extra argument to GenericUnivariateSelect without scope tricks

python

scikit-learn

pipeline

scoping