使用 lmodel2 包从简化的长轴回归模型中获取回归系数

Question

我有一个大数据集，我正在用它进行许多回归分析。我在 r 的 lmodel2 包中使用了简化的长轴回归。我需要做的是从 RMA 模型中提取回归系数（r 平方、p 值、斜率和截距）。我可以使用 OLS 回归轻松地做到这一点：

RSQ<-summary(model)$r.squared
PVAL<-summary(model)$coefficients[2,4]
INT<-summary(model)$coefficients[1,1]
SLOPE<-summary(model)$coefficients[2,1]

然后将它们导出为 .csv

export<-data.frame(RSQ,PVAL,INT,SLOPE)
write.csv(export, file="FILE_NAME.csv",row.names=F)

这些命令似乎不适用于 lmodel2 回归。有人知道怎么做吗？

这里是一小部分数据：

x            y
0.440895993 227.7
0.294277869 296.85
0.171754892 298.05
0           427.65
0.210884179 215.55
0.053238011 293.7
0.105395366 127.9
0.463933834 229.5
0           165.45
0.482128605 192.15
0.247341039 266.9
0           349.35
0.198833301 185.05
0.170786027 203.85
0.269818315 207.05
0.129543682 222.75
0.441665334 251.35
0           262.8
0.517974685 107.05
0.446336968 191.6

以及我正在使用的模型 II 回归代码

library(lmodel2)
data<-sample_data
mod_2<-lmodel2(y~x,data=data,"interval","interval",99)
mod_2

Answer 1

这个呢？

# making data reproducable
data <- read.table(text = "x            y
0.440895993 227.7
0.294277869 296.85
0.171754892 298.05
0           427.65
0.210884179 215.55
0.053238011 293.7
0.105395366 127.9
0.463933834 229.5
0           165.45
0.482128605 192.15
0.247341039 266.9
0           349.35
0.198833301 185.05
0.170786027 203.85
0.269818315 207.05
0.129543682 222.75
0.441665334 251.35
0           262.8
0.517974685 107.05
0.446336968 191.6", header = TRUE)

#estimate model
library(lmodel2)
mod_2 <- lmodel2(y ~ x, data = data, "interval", "interval", 99)  # 99% ci

简单看一下summary()，它提供了有关模型统计信息如何保存的信息。（您也可以尝试 str()）。

# view summary
summary(mod_2)
#                      Length Class      Mode   
# y                    20     -none-     numeric
# x                    20     -none-     numeric
# regression.results    5     data.frame list   
# confidence.intervals  5     data.frame list   
# eigenvalues           2     -none-     numeric
# H                     1     -none-     numeric
# n                     1     -none-     numeric
# r                     1     -none-     numeric
# rsquare               1     -none-     numeric
# P.param               1     -none-     numeric
# theta                 1     -none-     numeric
# nperm                 1     -none-     numeric
# epsilon               1     -none-     numeric
# info.slope            1     -none-     numeric
# info.CI               1     -none-     numeric
# call                  6     -none-     call

可以看出，GOF 的变量名称（您称它们为 'commands'）是包特定的。您可以 select 通过在 $ 运算符之后将它们添加到模型的对象名称中。

# Getting r squared
(RSQ <- mod_2$rsquare)
# [1] 0.1855163

对于系数及其统计数据 lmodel2 想要 $regression.results。

mod_2$regression.results
# Method Intercept     Slope Angle (degrees) P-perm (1-tailed)
# 1    OLS  277.2264 -177.0317       -89.67636              0.04
# 2     MA  457.7304 -954.2606       -89.93996              0.04
# 3    SMA  331.5673 -411.0173       -89.86060                NA
# 4    RMA  296.6245 -260.5577       -89.78010              0.04

# wanted results from the RMA model
(INT <- mod_2$regression.results[[2]][4])
# [1] 296.6245
(SLOPE <- mod_2$regression.results[[3]][4])
# [1] -260.5577
(PVAL <- mod_2$regression.results[[5]][4])
# [1] 0.04

# Combined together in a data frame:
data.frame(RMA = rbind(INT, SLOPE, PVAL))
#             RMA
# INT    296.6245
# SLOPE -260.5577
# PVAL     0.0400

使用 lmodel2 包从简化的长轴回归模型中获取回归系数

Obtaining regression coefficients from reduced major axis regression models using lmodel2 package

regression

r

intercept

p-value

coefficients