随机排列 DataFrame 行

Shuffle DataFrame rows

我有以下数据框:

    Col1  Col2  Col3  Type
0      1     2     3     1
1      4     5     6     1
...
20     7     8     9     2
21    10    11    12     2
...
45    13    14    15     3
46    16    17    18     3
...

DataFrame 是从 CSV 文件中读取的。所有 Type 1 的行都在顶部,然后是 Type 2 的行,然后是 Type 3 的行,等等

我想打乱 DataFrame 行的顺序,以便混合所有 Type。可能的结果可能是:

    Col1  Col2  Col3  Type
0      7     8     9     2
1     13    14    15     3
...
20     1     2     3     1
21    10    11    12     2
...
45     4     5     6     1
46    16    17    18     3
...

我怎样才能做到这一点?

您可以通过使用已打乱的索引进行索引来打乱数据框的行。为此,您可以使用 np.random.permutation(但也可以使用 np.random.choice):

In [12]: df = pd.read_csv(StringIO(s), sep="\s+")

In [13]: df
Out[13]: 
    Col1  Col2  Col3  Type
0      1     2     3     1
1      4     5     6     1
20     7     8     9     2
21    10    11    12     2
45    13    14    15     3
46    16    17    18     3

In [14]: df.iloc[np.random.permutation(len(df))]
Out[14]: 
    Col1  Col2  Col3  Type
46    16    17    18     3
45    13    14    15     3
20     7     8     9     2
0      1     2     3     1
1      4     5     6     1
21    10    11    12     2

如果你想保持索引从 1、2、..、n 开始,就像你的例子一样,你可以简单地重置索引:df_shuffled.reset_index(drop=True)

使用 Pandas 执行此操作的惯用方法是使用数据框的 .sample 方法对所有行进行无替换采样:

df.sample(frac=1)

frac 关键字参数指定随机样本中 return 行的分数,因此 frac=1 表示 return 所有行(以随机顺序)。


注: 如果你想洗牌你的数据帧 in-place 并重置索引,你可以这样做

df = df.sample(frac=1).reset_index(drop=True)

此处,指定 drop=True 可防止 .reset_index 创建包含旧索引条目的列。

Follow-up注:虽然上面的操作看起来可能不像是in-place,python/pandas 足够聪明,不会为洗牌后的对象再做一次 malloc。也就是说,即使 reference 对象已更改(我的意思是 id(df_old)id(df_new) 不同),底层 C 对象仍然相同.为了证明确实如此,您可以 运行 一个简单的内存分析器:

$ python3 -m memory_profiler .\test.py
Filename: .\test.py

Line #    Mem usage    Increment   Line Contents
================================================
     5     68.5 MiB     68.5 MiB   @profile
     6                             def shuffle():
     7    847.8 MiB    779.3 MiB       df = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 1000000))
     8    847.9 MiB      0.1 MiB       df = df.sample(frac=1).reset_index(drop=True)

你可以简单地使用 sklearn 来完成这个

from sklearn.utils import shuffle
df = shuffle(df)

TL;DR: np.random.shuffle(ndarray) 可以胜任。
所以,在你的情况下

np.random.shuffle(DataFrame.values)

DataFrame,在幕后,使用 NumPy ndarray 作为数据持有者。 (您可以从DataFrame source code查看)

因此,如果您使用 np.random.shuffle(),它会沿 multi-dimensional 数组的第一个轴打乱数组。但是 DataFrame 的索引保持不变。

不过,有几点需要考虑。

  • 函数returnsnone。如果您想保留原始对象的副本,则必须在传递给函数之前这样做。
  • sklearn.utils.shuffle(),正如用户 tj89 所建议的,可以指定 random_state 以及另一个控制输出的选项。出于开发目的,您可能需要它。
  • sklearn.utils.shuffle() 更快。但是将洗牌 DataFrame 的轴信息(索引,列)及其包含的 ndarray

基准测试结果

介于 sklearn.utils.shuffle()np.random.shuffle() 之间。

ndarray

nd = sklearn.utils.shuffle(nd)

0.10793248389381915 秒。 快 8 倍

np.random.shuffle(nd)

0.8897626010002568 秒

数据帧

df = sklearn.utils.shuffle(df)

0.3183923360193148 秒。 快 3 倍

np.random.shuffle(df.values)

0.9357550159329548 秒

Conclusion: If it is okay to axis info(index, column) to be shuffled along with ndarray, use sklearn.utils.shuffle(). Otherwise, use np.random.shuffle()

使用代码

import timeit
setup = '''
import numpy as np
import pandas as pd
import sklearn
nd = np.random.random((1000, 100))
df = pd.DataFrame(nd)
'''

timeit.timeit('nd = sklearn.utils.shuffle(nd)', setup=setup, number=1000)
timeit.timeit('np.random.shuffle(nd)', setup=setup, number=1000)
timeit.timeit('df = sklearn.utils.shuffle(df)', setup=setup, number=1000)
timeit.timeit('np.random.shuffle(df.values)', setup=setup, number=1000)

通过在本例中采用样本数组 index 随机化 pandas 数据帧并随机化其顺序,然后将数组设置为数据帧的索引。现在根据索引对数据框进行排序。这是你的随机数据框

import random
df = pd.DataFrame({"a":[1,2,3,4],"b":[5,6,7,8]})
index = [i for i in range(df.shape[0])]
random.shuffle(index)
df.set_index([index]).sort_index()

输出

    a   b
0   2   6
1   1   5
2   3   7
3   4   8

将你的数据框插入到上面代码中我的位置。

这是另一种方法:

df_shuffled = df.reindex(np.random.permutation(df.index))

(我没有足够的声誉在顶部评论此 post,所以我希望其他人可以为我做这件事。) 有一个第一种方法引起关注:

df.sample(frac=1)

它进行了深度复制或只是更改了数据帧。我运行以下代码:

print(hex(id(df)))
print(hex(id(df.sample(frac=1))))
print(hex(id(df.sample(frac=1).reset_index(drop=True))))

我的结果是:

0x1f8a784d400
0x1f8b9d65e10
0x1f8b9d65b70

这意味着该方法 不是 返回相同的对象,如上一条评论中所建议的那样。所以这个方法确实做了一个洗牌 copy.

这是另一种方式:

df['rnd'] = np.random.rand(len(df))
df = df.sort_values(by='rnd', inplace=True).drop('rnd', axis=1)

还有什么有用的,如果您将它用于 Machine_learning 并希望始终分离相同的数据,您可以使用:

df.sample(n=len(df), random_state=42)

这确保您的随机选择始终可复制

以下可能是其中一种方法:

dataframe = dataframe.sample(frac=1, random_state=42).reset_index(drop=True)

哪里

frac=1表示一个数据框的所有行

random_state=42表示每次执行都保持相同的顺序

reset_index(drop=True) 表示重新初始化随机数据帧的索引

通过传递 frac 参数,使用 sample() 随机播放 DataFrame。 将打乱后的 DataFrame 保存到新变量中。

new_variable = DataFrame.sample(frac=1)