每行的最大列

Question

我是R新手，无法为您制作示例数据框，对此深表歉意。但是，我正在进行细菌群落分析，并且我有一个 table，其中每一列都有物种，每一行都有每个样本。每列是每个物种的标识符。数据框中是每个样本的物种丰度。我的目标是为每个样本（行）确定最丰富的物种（列）。我认为制作一个包含具有最丰富物种列标识符的样本（行）的数据框将是最有用的！我试过的迭代（使用 phyloseq 包，但可以在没有这个包的情况下使用）。

beagle <- names(sort(taxa_sums(top.pdy.phyl),T, function(x) which(max==x)))
beagle2 <- names(taxa_sums(top.pdy.phyl),T, function(x) colnames(which.max(top.pdy.phyl))))

如有任何帮助，我们将不胜感激！谢谢！

Answer 1

怎么样：

names(top.pdy.phyl)[ apply(top.pdy.phyl, 1, which.max) ]

和

apply(top.pdy.phyl, 1 , max)

每行的最大列

Max Column for each Row

r

dataframe

phyloseq