R - 在 x 轴和 y 轴上使用具有不同变量的 corrplot

R - Using corrplot with different variables on x and y axes

你们可能都知道,corrplot 可用于创建漂亮的图表,可视化一组变量之间关系的强度,x 轴上的变量与 y 轴上的变量相同(通常是对称的) ,除非您在上对角线上的指标与下对角线上的指标不同)。我想以稍微不同的方式使用 corrplot。

假设我有一个如下所示的数据框:

var1 var2 beta  se   pvalue
X    a    .01   .01  .35
X    b    -.02  .02  .45
X    c    .04   .01  .55
X    d    .04   .01  .55
Y    a    .06   .01  .01
Y    b    -.02  .02  .25
Y    c    .04   .01  .55
Y    d    .02   .01  .55
Z    a    .04   .01  .01
Z    b    -.01  .01  .45
Z    c    .03   .02  .02
Z    d    .04   .02  .02

我可以使用 corrplot 创建一个在 x 轴上具有变量 X、Y 和 Z,在 Y 轴上具有变量 a、b、c 和 d 的图形吗?如果是,如何?

PS。我要绘制的值是 beta。

编辑:我将示例文件编辑为关于 x 和 y 上的变量 nr 的非对称

您可以将数据重新整形为方阵,然后将其输入 corrplot。 即使生成的矩阵不是正方形,这也有效。

## Your new data
Dat = read.table(text="var1 var2 beta  se   pvalue
X    a    .01   .01  .35
X    b    -.02  .02  .45
X    c    .04   .01  .55
X    d    .04   .01  .55
Y    a    .06   .01  .01
Y    b    -.02  .02  .25
Y    c    .04   .01  .55
Y    d    .02   .01  .55
Z    a    .04   .01  .01
Z    b    -.01  .01  .45
Z    c    .03   .02  .02
Z    d    .04   .02  .02",
header=TRUE)

## Now reshape the data  (same as before)
wide = reshape(Dat[,1:3], idvar = c("var1"),
    timevar="var2", direction = "wide")
rownames(wide) = wide$var1
wide = wide[,-1]
colnames(wide) = sub("beta.", "", colnames(wide))

## Pass it to corrplot
library(corrplot)
corrplot(as.matrix(wide), is.corr=FALSE, tl.srt=0)