随机采样一个 python 集而不转换为列表

Randomly Sample a python Set without converting to list

问题

我花了很多时间阅读有关在 python 中获取随机样本的各种答案,random.sample 似乎是自然而最常见的选择,但我正在尝试抽样来自 python set 对象,并希望能够高效地完成它。

由于 python 中非常好的和高效的集合功能(交叉点、差异等),我正在使用集合。就我的目的而言,集合是一种非常有效的数据结构,而列表则不是。我有一个算法情况,我在一个集合中有 N 个元素,并且可能需要为集合的每个采样占用任意大小的 N 个子样本。该集合的每个子采样都不是完全相同的集合,并且由我必须生成子样本的每个元素的属性定义。下面是一些模糊的代码,展示了算法的复杂性:

main_set = set(...) # Values sourced from elsewhere.
capacity = 20

for element in list:
    potential_values = main_set - element.set # Exclude values already in element
    sample_size = capacity - len(element.set) # Num needed to fill the set to capacity
    new_vals = sample(potential_values, sample_size) # <- insert sampling idea here

    element.set = element.set | new_vals # Union of sample and element set

根据我在网上收集的信息和一些测试,random.sample 似乎将 set 转换为 list 对象。 main_set - element.setpotential_values 的大小几乎总是远大于 element.set 的大小,因此如果必须在每次采样时将 potential_values 转换为列表,则算法将受到影响性能非常好。

那么,对于如何使用集合有效地执行此操作,有没有人有任何建议或想法?我感谢任何关于此事的意见,在任何人跳到 'premature optimization' 例程之前,我非常清楚这将要执行的规模以及 O(n) 和 O(n) 之间的区别^2) 相当可观。


澄清编辑:

我特别关心所提供的任何sample()方法的输出。我从 potential_values 中提取的实际样本与 potential_values 的大小相比 。相反,所有建议的 sample() 方法都需要类似列表的输入才能工作,这意味着 potential_values 必须首先转换为可索引类型,这是我想要避免的。

我现在还意识到我以一种非常模糊的方式提出了大 O 表示法,可能不应该这样做。当我说我想避免 O(n^2) 时,我的意思是我想避免在循环内添加另一个 O(n) 操作。正如有人向我指出的那样,main_set - element.setlist(main_set) 具有相同的时间复杂度,因此它已经是 O(n^2)。添加 list 转换使整个算法更像 O(2n^2),但其中的 none 非常重要。

你可以使用 heapq.nlargest 它可以接受任何可迭代对象并为其提供一个随机键来选择,例如:

import random, heapq

sample = heapq.nlargest(sample_size, your_set, key=lambda L: random.random())

注意 - 这会给你一个 list 对象,所以你需要在必要时转换它...

在 IPython 中快速尝试计时表明使用 heapq.nlargest 不一定比您现有的方法更好,请根据实际数据的特点适当调整:

import random
import heapq

set_size = 100000
sample_size = 1000

def sample_heapq(your_set, sample_size):
    sample = heapq.nlargest(sample_size, your_set, key = lambda e: random.random())
    return sample

def sample_original(your_set, sample_size):
    sample = random.sample(your_set, sample_size)
    return sample

eg_set = set(range(sample_size))

运行 这些通过 timeit:

%timeit sample_heapq(eg_set, sample_size)
1000 loops, best of 3: 523 µs per loop

%timeit sample_original(eg_set, sample_size)
1000 loops, best of 3: 479 µs per loop

正如@user2357112 所建议的,这是我原始问题中代码的拒绝采样版本,它有效地从源集中采样 n 个元素,因为我只从 main_set 中采样尚未存在的值elements.set

main_set = set(...) # Values sourced from elsewhere.
capacity = 20
listed_set = list(main_set) # initially convert set to list so we can sample
for element in list:
    while len(element.set) < capacity
        item = random.choice(listed_set)
        element.set.add(item) # Sets cannot contain duplicates, no conditional required

虽然这没有回答如何直接从 python 中的 set 进行采样的问题,但它确实有效地解决了我的算法试图做的事情。如果一段时间后,没有人想出直接从集合中采样或比这更有效的方法,我可能会将其标记为答案。感谢 @user2357112 的想法!


正如@LieRyan 指出的那样,如果 element.setmain_set 重叠很大一部分,该算法将无法从 random.choice() 中获取非重叠项。因此,如果我们期望重叠度很高,例如 50%,那么只需使用 main_set - element.set 获取两个集合之间的唯一项,并将其转换为列表,将比此方法快得多。本质上,该算法适用于 main_setelement.set 几乎没有重叠的情况(占 main_set 的百分比)。

取决于你对随机的定义。

只是一些元素,我不在乎是哪个:

[s.copy().pop() for i in range(count)]  # with replacement

copy = s.copy()
[copy.pop() for i in range(count)]  # without replacement

具有良好[伪]随机分布的元素:

copy = list(s)
random.sample(copy, count)

可重复的伪随机分布:

copy = sorted(s)
# random.seed(...)
random.sample(copy, count)

可重复伪随机,假设,运行时开销更少:

heapq.nlargest(...)  # per Jon or Marius

讨论:

  • set.pop() 已经删除并且 returns 任意元素,但是如果对象散列值在集合中相同,则这是完全可以预测的,例如如果每次都是相同的一组数字,如果每次设置不同也可以接受
  • set.copy()O(N)
  • sorted();list.sort()O(NlogN) 摊销的,可能因为集合是由散列随机化的
  • heapq.nlargest 可能是 O(N) 每个 Median of Medians,Python 实现是一个恒定大小的二进制堆,使其成为 O(N*log(n)),因为 N 元素是通过大小为 n 的堆筛过滤。请注意,sing key= 会增加显着的线性开销,因此 O(C*N*log(n)),您的域将决定是否 C*log(n) <?> logN