重塑数据 table 以将列名转换为行名

Question

我在 R

中有一个 data.table

> dt
  SAMPLE   junction count
1: R1        a       1
2: R2        a       1
3: R3        b       1
4: R3        a       1
5: R1        c       2

现在我想"reshape"数据table组成一个data framem（基本上是通过样本矩阵与索引值的连接作为对应的计数值）。此外，请注意对于 dt 中不存在的 (SAMPLE,junction) 对，我假设对应的 count 值为 zero。有人可以帮助我如何实现这一目标吗？

> m
      R1   R2   R3
  a    1    1    1
  b    0    0    1
  c    2    0    0

Answer 1

data.table 中的 dcast 将数据集从 'long' 格式更改为 'wide' 格式。

library(data.table)#v1.9.5+
dcast(dt, junction~SAMPLE, value.var='count', fill=0)
#   junction R1 R2 R3
#1:        a  1  1  1
#2:        b  0  0  1
#3:        c  2  0  0

如果需要矩阵输出

library(reshape2)
acast(dt, junction~SAMPLE, value.var='count', fill=0)
#   R1 R2 R3
#a  1  1  1
#b  0  0  1
#c  2  0  0

或 xtabs 来自 base R

 xtabs(count~junction+SAMPLE, dt)

Answer 2

使用 tidyr 中的 spread 的替代方法：

library(tidyr)

spread(dt, SAMPLE, count, fill=0)
#   junction R1 R2 R3
#1:        a  1  1  1
#2:        b  0  0  1
#3:        c  2  0  0

或 stats 中 reshape 的老派解决方案：

reshape(dt, timevar='SAMPLE', idvar=c('junction'), direction='wide')
#   junction count.R1 count.R2 count.R3
#1:        a        1        1        1
#2:        b       NA       NA        1
#3:        c        2       NA       NA

数据：

dt = structure(list(SAMPLE = c("R1", "R2", "R3", "R3", "R1"), junction = c("a", 
"a", "b", "a", "c"), count = c(1, 1, 1, 1, 2)), .Names = c("SAMPLE", 
"junction", "count"), row.names = c(NA, -5L), class = c("data.table", 
"data.frame"), .internal.selfref = <pointer: 0x05e924a0>)

重塑数据 table 以将列名转换为行名

Reshaping data table to make column names into row names

r

reshape

reshape2

data.table