Python Pandas:计算可变行数的滚动平均值(移动平均值)

Python Pandas: calculate rolling mean (moving average) over variable number of rows

假设我有以下数据框

import pandas as pd
df = pd.DataFrame({ 'distance':[2.0, 3.0, 1.0, 4.0],
                    'velocity':[10.0, 20.0, 5.0, 40.0] })

给出数据框

   distance  velocity
0         2.0        10.0
1         3.0        20.0
2         1.0        5.0
3         4.0        40.0

如何计算速度列与距离列滚动总和的平均值?在上面的示例中,对最后 N 行创建滚动总和以获得最小累积距离 5,然后计算这些行的平均速度。

我的目标输出将是这样的:

   distance  velocity    rv
0         2.0        10.0    NaN
1         3.0        20.0    15.0
2         1.0         5.0    11.7
3         4.0        40.0    22.5

哪里

15.0 = (10+20)/2        (2 because 3 + 2     >= 5)
11.7 = (10 + 20 + 5)/3  (3 because 1 + 3 + 2 >= 5) 
22.5 = (5 + 40)/2       (2 because 4 + 1     >= 5)

更新:在Pandas-speak中,我的代码应该从我的当前记录中找到反向累积距离总和的索引(这样它是5或更大),然后使用该指数计算移动平均线的起点。

不是一个特别熊猫式的解决方案,但听起来你想做类似

的事情
df['rv'] = np.nan
for i in range(len(df)):
    j = i
    s = 0
    while j >= 0 and s < 5:
        s += df['distance'].loc[j]
        j -= 1
    if s >= 5:
        df['rv'].loc[i] = df['velocity'][j+1:i+1].mean()

更新:由于这个答案,OP 表示他们想要 "valid Pandas solution (e.g. without loops)"。如果我们认为这意味着他们想要比上述更高性能的东西,那么,也许具有讽刺意味的是,考虑到评论,第一个想到的优化是避免数据框,除非需要:

l = len(df)
a = np.empty(l)
d = df['distance'].values
v = df['velocity'].values
for i in range(l):
    j = i
    s = 0
    while j >= 0 and s < 5:
        s += d[j]
        j -= 1
    if s >= 5:
        a[i] = v[j+1:i+1].mean()
df['rv'] = a

此外,正如@JohnE 所建议的,numba 很快就派上用场以进行进一步优化。虽然它不会对上面的第一个解决方案做太多事情,但第二个解决方案可以用 @numba.jit 开箱即用的装饰来立即带来好处。在

上对所有三种解决方案进行基准测试
pd.DataFrame({'velocity': 50*np.random.random(10000), 'distance': 5*np.random.rand(10000)})

我得到以下结果:

          Method                 Benchmark
-----------------------------------------------
Original data frame based     4.65 s ± 325 ms
Pure numpy array based       80.8 ms ± 9.95 ms
Jitted numpy array based      766 µs ± 52 µs

再无辜的mean也足以摆脱numba;如果我们摆脱它并改用

@numba.jit
def numba_example():
    l = len(df)
    a = np.empty(l)
    d = df['distance'].values
    v = df['velocity'].values
    for i in range(l):
        j = i
        s = 0
        while j >= 0 and s < 5:
            s += d[j]
            j -= 1
        if s >= 5:
            for k in range(j+1, i+1):
                a[i] += v[k]
            a[i] /= (i-j)
    df['rv'] = a

然后基准减少到 158 µs ± 8.41 µs。

现在,如果您碰巧对df['distance']的结构了解得更多,while循环可能会进一步优化。 (例如,如果值恰好总是远低于 5,则从其尾部切掉累积和会比重新计算所有内容更快。)

怎么样

df.rolling(window=3, min_periods=2).mean()

   distance   velocity
0       NaN        NaN
1  2.500000  15.000000
2  2.000000  11.666667
3  2.666667  21.666667

合并它们

df['rv'] = df.velocity.rolling(window=3, min_periods=2).mean()

看起来 window 形状有点不对劲。